Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR4

Apbb2, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 2, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb2Q9DBR4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Apbb2Q9DBR4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apbb2Q9DBR4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apbb2Q9DBR4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apbb2Q9DBR4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Apbb2Q9DBR4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Apbb2Q9DBR4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apbb2Q9DBR4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Apbb2Q9DBR4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Apbb2Q9DBR4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apbb2Q9DBR4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apbb2Q9DBR4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apbb2Q9DBR4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apbb2Q9DBR4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apbb2Q9DBR4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Apbb2Q9DBR4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Apbb2Q9DBR4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apbb2Q9DBR4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apbb2Q9DBR4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apbb2Q9DBR4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Apbb2Q9DBR4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apbb2Q9DBR4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apbb2Q9DBR4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apbb2Q9DBR4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apbb2Q9DBR4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Apbb2Q9DBR4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apbb2Q9DBR4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apbb2Q9DBR4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apbb2Q9DBR4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apbb2Q9DBR4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Apbb2Q9DBR4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Apbb2Q9DBR4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apbb2Q9DBR4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apbb2Q9DBR4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apbb2Q9DBR4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Apbb2Q9DBR4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apbb2Q9DBR4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apbb2Q9DBR4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apbb2Q9DBR4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Apbb2Q9DBR4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Apbb2Q9DBR4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apbb2Q9DBR4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apbb2Q9DBR4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apbb2Q9DBR4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apbb2Q9DBR4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apbb2Q9DBR4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apbb2Q9DBR4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apbb2Q9DBR4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apbb2Q9DBR4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apbb2Q9DBR4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apbb2Q9DBR4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apbb2Q9DBR4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apbb2Q9DBR4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apbb2Q9DBR4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apbb2Q9DBR4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apbb2Q9DBR4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apbb2Q9DBR4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apbb2Q9DBR4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Apbb2Q9DBR4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apbb2Q9DBR4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apbb2Q9DBR4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apbb2Q9DBR4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apbb2Q9DBR4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apbb2Q9DBR4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apbb2Q9DBR4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apbb2Q9DBR4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apbb2Q9DBR4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apbb2Q9DBR4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apbb2Q9DBR4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apbb2Q9DBR4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apbb2Q9DBR4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apbb2Q9DBR4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apbb2Q9DBR4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apbb2Q9DBR4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apbb2Q9DBR4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apbb2Q9DBR4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apbb2Q9DBR4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apbb2Q9DBR4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apbb2Q9DBR4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apbb2Q9DBR4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Apbb2Q9DBR4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apbb2Q9DBR4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apbb2Q9DBR4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apbb2Q9DBR4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apbb2Q9DBR4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apbb2Q9DBR4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apbb2Q9DBR4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apbb2Q9DBR4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apbb2Q9DBR4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apbb2Q9DBR4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apbb2Q9DBR4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apbb2Q9DBR4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apbb2Q9DBR4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apbb2Q9DBR4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Apbb2Q9DBR4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apbb2Q9DBR4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apbb2Q9DBR4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apbb2Q9DBR4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apbb2Q9DBR4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apbb2Q9DBR4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms