Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC3

Cmtr1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtr1Q9DBC3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cmtr1Q9DBC3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cmtr1Q9DBC3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cmtr1Q9DBC3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cmtr1Q9DBC3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cmtr1Q9DBC3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cmtr1Q9DBC3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cmtr1Q9DBC3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cmtr1Q9DBC3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cmtr1Q9DBC3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cmtr1Q9DBC3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cmtr1Q9DBC3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cmtr1Q9DBC3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cmtr1Q9DBC3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cmtr1Q9DBC3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cmtr1Q9DBC3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cmtr1Q9DBC3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cmtr1Q9DBC3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cmtr1Q9DBC3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Cmtr1Q9DBC3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cmtr1Q9DBC3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cmtr1Q9DBC3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cmtr1Q9DBC3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cmtr1Q9DBC3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cmtr1Q9DBC3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cmtr1Q9DBC3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cmtr1Q9DBC3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cmtr1Q9DBC3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cmtr1Q9DBC3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cmtr1Q9DBC3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cmtr1Q9DBC3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cmtr1Q9DBC3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cmtr1Q9DBC3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cmtr1Q9DBC3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cmtr1Q9DBC3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cmtr1Q9DBC3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cmtr1Q9DBC3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cmtr1Q9DBC3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cmtr1Q9DBC3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cmtr1Q9DBC3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cmtr1Q9DBC3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cmtr1Q9DBC3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cmtr1Q9DBC3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cmtr1Q9DBC3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cmtr1Q9DBC3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cmtr1Q9DBC3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cmtr1Q9DBC3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cmtr1Q9DBC3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cmtr1Q9DBC3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cmtr1Q9DBC3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cmtr1Q9DBC3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cmtr1Q9DBC3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cmtr1Q9DBC3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cmtr1Q9DBC3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cmtr1Q9DBC3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cmtr1Q9DBC3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cmtr1Q9DBC3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cmtr1Q9DBC3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cmtr1Q9DBC3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cmtr1Q9DBC3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cmtr1Q9DBC3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cmtr1Q9DBC3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cmtr1Q9DBC3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cmtr1Q9DBC3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cmtr1Q9DBC3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cmtr1Q9DBC3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cmtr1Q9DBC3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cmtr1Q9DBC3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cmtr1Q9DBC3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cmtr1Q9DBC3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cmtr1Q9DBC3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cmtr1Q9DBC3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cmtr1Q9DBC3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cmtr1Q9DBC3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cmtr1Q9DBC3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cmtr1Q9DBC3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cmtr1Q9DBC3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cmtr1Q9DBC3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cmtr1Q9DBC3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cmtr1Q9DBC3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cmtr1Q9DBC3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cmtr1Q9DBC3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cmtr1Q9DBC3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cmtr1Q9DBC3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cmtr1Q9DBC3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cmtr1Q9DBC3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cmtr1Q9DBC3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cmtr1Q9DBC3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cmtr1Q9DBC3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cmtr1Q9DBC3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cmtr1Q9DBC3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cmtr1Q9DBC3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cmtr1Q9DBC3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cmtr1Q9DBC3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cmtr1Q9DBC3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cmtr1Q9DBC3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cmtr1Q9DBC3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cmtr1Q9DBC3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cmtr1Q9DBC3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cmtr1Q9DBC3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.9 ms