Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med29Q9DB91 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med29Q9DB91 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med29Q9DB91 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med29Q9DB91 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med29Q9DB91 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med29Q9DB91 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med29Q9DB91 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med29Q9DB91 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med29Q9DB91 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med29Q9DB91 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med29Q9DB91 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med29Q9DB91 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Med29Q9DB91 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Med29Q9DB91 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Med29Q9DB91 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Med29Q9DB91 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Med29Q9DB91 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Med29Q9DB91 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med29Q9DB91 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med29Q9DB91 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med29Q9DB91 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med29Q9DB91 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med29Q9DB91 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med29Q9DB91 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Med29Q9DB91 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med29Q9DB91 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med29Q9DB91 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med29Q9DB91 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med29Q9DB91 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med29Q9DB91 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Med29Q9DB91 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Med29Q9DB91 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Med29Q9DB91 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Med29Q9DB91 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Med29Q9DB91 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Med29Q9DB91 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Med29Q9DB91 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Med29Q9DB91 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Med29Q9DB91 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Med29Q9DB91 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Med29Q9DB91 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Med29Q9DB91 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Med29Q9DB91 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Med29Q9DB91 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Med29Q9DB91 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Med29Q9DB91 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Med29Q9DB91 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Med29Q9DB91 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Med29Q9DB91 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Med29Q9DB91 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Med29Q9DB91 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Med29Q9DB91 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Med29Q9DB91 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Med29Q9DB91 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Med29Q9DB91 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Med29Q9DB91 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Med29Q9DB91 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Med29Q9DB91 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Med29Q9DB91 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Med29Q9DB91 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Med29Q9DB91 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Med29Q9DB91 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Med29Q9DB91 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Med29Q9DB91 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Med29Q9DB91 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Med29Q9DB91 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Med29Q9DB91 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Med29Q9DB91 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Med29Q9DB91 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Med29Q9DB91 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Med29Q9DB91 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Med29Q9DB91 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Med29Q9DB91 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Med29Q9DB91 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Med29Q9DB91 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Med29Q9DB91 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Med29Q9DB91 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Med29Q9DB91 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med29Q9DB91 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med29Q9DB91 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med29Q9DB91 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med29Q9DB91 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med29Q9DB91 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med29Q9DB91 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med29Q9DB91 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med29Q9DB91 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med29Q9DB91 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med29Q9DB91 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med29Q9DB91 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med29Q9DB91 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Med29Q9DB91 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Med29Q9DB91 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Med29Q9DB91 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Med29Q9DB91 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Med29Q9DB91 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Med29Q9DB91 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Med29Q9DB91 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Med29Q9DB91 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Med29Q9DB91 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.1 ms