Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB16

Cab39l, Calcium-binding protein 39-like, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39lQ9DB16 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cab39lQ9DB16 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cab39lQ9DB16 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cab39lQ9DB16 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cab39lQ9DB16 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cab39lQ9DB16 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cab39lQ9DB16 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cab39lQ9DB16 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cab39lQ9DB16 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cab39lQ9DB16 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cab39lQ9DB16 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cab39lQ9DB16 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cab39lQ9DB16 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cab39lQ9DB16 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cab39lQ9DB16 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cab39lQ9DB16 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cab39lQ9DB16 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cab39lQ9DB16 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cab39lQ9DB16 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cab39lQ9DB16 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cab39lQ9DB16 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cab39lQ9DB16 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cab39lQ9DB16 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cab39lQ9DB16 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cab39lQ9DB16 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cab39lQ9DB16 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cab39lQ9DB16 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cab39lQ9DB16 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cab39lQ9DB16 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cab39lQ9DB16 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cab39lQ9DB16 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cab39lQ9DB16 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cab39lQ9DB16 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cab39lQ9DB16 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cab39lQ9DB16 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cab39lQ9DB16 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cab39lQ9DB16 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cab39lQ9DB16 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cab39lQ9DB16 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cab39lQ9DB16 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cab39lQ9DB16 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cab39lQ9DB16 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cab39lQ9DB16 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cab39lQ9DB16 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cab39lQ9DB16 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cab39lQ9DB16 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cab39lQ9DB16 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cab39lQ9DB16 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cab39lQ9DB16 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cab39lQ9DB16 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cab39lQ9DB16 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cab39lQ9DB16 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cab39lQ9DB16 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cab39lQ9DB16 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cab39lQ9DB16 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cab39lQ9DB16 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cab39lQ9DB16 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cab39lQ9DB16 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cab39lQ9DB16 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cab39lQ9DB16 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cab39lQ9DB16 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cab39lQ9DB16 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cab39lQ9DB16 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cab39lQ9DB16 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cab39lQ9DB16 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cab39lQ9DB16 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cab39lQ9DB16 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cab39lQ9DB16 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cab39lQ9DB16 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cab39lQ9DB16 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cab39lQ9DB16 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cab39lQ9DB16 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cab39lQ9DB16 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cab39lQ9DB16 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cab39lQ9DB16 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cab39lQ9DB16 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cab39lQ9DB16 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cab39lQ9DB16 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cab39lQ9DB16 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cab39lQ9DB16 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cab39lQ9DB16 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cab39lQ9DB16 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cab39lQ9DB16 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cab39lQ9DB16 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cab39lQ9DB16 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cab39lQ9DB16 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cab39lQ9DB16 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cab39lQ9DB16 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cab39lQ9DB16 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cab39lQ9DB16 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cab39lQ9DB16 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cab39lQ9DB16 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cab39lQ9DB16 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cab39lQ9DB16 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cab39lQ9DB16 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cab39lQ9DB16 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cab39lQ9DB16 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cab39lQ9DB16 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cab39lQ9DB16 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cab39lQ9DB16 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms