Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAM1

Lrrc34, Leucine-rich repeat-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc34Q9DAM1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc34Q9DAM1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc34Q9DAM1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc34Q9DAM1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc34Q9DAM1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc34Q9DAM1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc34Q9DAM1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc34Q9DAM1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc34Q9DAM1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc34Q9DAM1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc34Q9DAM1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc34Q9DAM1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc34Q9DAM1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc34Q9DAM1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc34Q9DAM1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc34Q9DAM1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc34Q9DAM1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc34Q9DAM1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc34Q9DAM1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc34Q9DAM1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc34Q9DAM1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc34Q9DAM1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc34Q9DAM1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc34Q9DAM1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc34Q9DAM1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc34Q9DAM1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrrc34Q9DAM1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrrc34Q9DAM1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrrc34Q9DAM1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrrc34Q9DAM1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc34Q9DAM1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc34Q9DAM1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc34Q9DAM1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc34Q9DAM1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc34Q9DAM1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc34Q9DAM1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc34Q9DAM1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc34Q9DAM1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc34Q9DAM1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc34Q9DAM1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc34Q9DAM1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc34Q9DAM1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc34Q9DAM1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc34Q9DAM1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc34Q9DAM1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc34Q9DAM1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc34Q9DAM1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc34Q9DAM1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc34Q9DAM1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc34Q9DAM1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc34Q9DAM1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc34Q9DAM1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc34Q9DAM1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc34Q9DAM1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc34Q9DAM1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc34Q9DAM1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc34Q9DAM1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc34Q9DAM1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc34Q9DAM1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc34Q9DAM1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc34Q9DAM1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc34Q9DAM1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc34Q9DAM1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc34Q9DAM1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc34Q9DAM1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc34Q9DAM1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Lrrc34Q9DAM1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Lrrc34Q9DAM1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc34Q9DAM1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc34Q9DAM1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc34Q9DAM1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc34Q9DAM1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc34Q9DAM1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc34Q9DAM1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc34Q9DAM1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc34Q9DAM1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc34Q9DAM1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc34Q9DAM1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc34Q9DAM1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc34Q9DAM1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc34Q9DAM1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc34Q9DAM1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc34Q9DAM1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc34Q9DAM1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc34Q9DAM1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc34Q9DAM1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc34Q9DAM1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc34Q9DAM1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc34Q9DAM1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc34Q9DAM1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Lrrc34Q9DAM1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc34Q9DAM1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc34Q9DAM1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc34Q9DAM1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc34Q9DAM1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc34Q9DAM1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc34Q9DAM1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc34Q9DAM1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc34Q9DAM1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc34Q9DAM1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms