Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smim23Q9DAL0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smim23Q9DAL0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smim23Q9DAL0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smim23Q9DAL0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smim23Q9DAL0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smim23Q9DAL0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smim23Q9DAL0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smim23Q9DAL0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smim23Q9DAL0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smim23Q9DAL0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smim23Q9DAL0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smim23Q9DAL0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smim23Q9DAL0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smim23Q9DAL0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smim23Q9DAL0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smim23Q9DAL0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smim23Q9DAL0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smim23Q9DAL0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smim23Q9DAL0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smim23Q9DAL0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smim23Q9DAL0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smim23Q9DAL0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smim23Q9DAL0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smim23Q9DAL0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smim23Q9DAL0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smim23Q9DAL0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smim23Q9DAL0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smim23Q9DAL0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smim23Q9DAL0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smim23Q9DAL0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Smim23Q9DAL0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smim23Q9DAL0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smim23Q9DAL0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smim23Q9DAL0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smim23Q9DAL0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smim23Q9DAL0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smim23Q9DAL0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smim23Q9DAL0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smim23Q9DAL0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smim23Q9DAL0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smim23Q9DAL0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smim23Q9DAL0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smim23Q9DAL0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Smim23Q9DAL0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smim23Q9DAL0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smim23Q9DAL0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smim23Q9DAL0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smim23Q9DAL0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smim23Q9DAL0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smim23Q9DAL0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smim23Q9DAL0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smim23Q9DAL0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smim23Q9DAL0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smim23Q9DAL0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smim23Q9DAL0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smim23Q9DAL0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smim23Q9DAL0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smim23Q9DAL0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smim23Q9DAL0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smim23Q9DAL0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smim23Q9DAL0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smim23Q9DAL0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smim23Q9DAL0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smim23Q9DAL0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smim23Q9DAL0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smim23Q9DAL0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smim23Q9DAL0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smim23Q9DAL0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smim23Q9DAL0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smim23Q9DAL0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smim23Q9DAL0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smim23Q9DAL0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smim23Q9DAL0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smim23Q9DAL0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smim23Q9DAL0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smim23Q9DAL0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smim23Q9DAL0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smim23Q9DAL0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smim23Q9DAL0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Smim23Q9DAL0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smim23Q9DAL0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smim23Q9DAL0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smim23Q9DAL0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smim23Q9DAL0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smim23Q9DAL0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smim23Q9DAL0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smim23Q9DAL0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smim23Q9DAL0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smim23Q9DAL0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smim23Q9DAL0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smim23Q9DAL0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smim23Q9DAL0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smim23Q9DAL0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smim23Q9DAL0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smim23Q9DAL0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smim23Q9DAL0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smim23Q9DAL0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smim23Q9DAL0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smim23Q9DAL0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms