Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAG9

Phf7, PHD finger protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf7Q9DAG9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Phf7Q9DAG9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Phf7Q9DAG9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Phf7Q9DAG9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Phf7Q9DAG9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Phf7Q9DAG9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Phf7Q9DAG9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Phf7Q9DAG9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Phf7Q9DAG9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Phf7Q9DAG9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Phf7Q9DAG9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Phf7Q9DAG9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Phf7Q9DAG9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Phf7Q9DAG9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Phf7Q9DAG9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Phf7Q9DAG9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Phf7Q9DAG9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Phf7Q9DAG9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Phf7Q9DAG9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Phf7Q9DAG9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Phf7Q9DAG9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Phf7Q9DAG9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Phf7Q9DAG9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Phf7Q9DAG9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Phf7Q9DAG9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Phf7Q9DAG9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Phf7Q9DAG9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Phf7Q9DAG9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Phf7Q9DAG9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Phf7Q9DAG9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Phf7Q9DAG9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Phf7Q9DAG9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Phf7Q9DAG9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Phf7Q9DAG9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Phf7Q9DAG9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Phf7Q9DAG9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Phf7Q9DAG9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Phf7Q9DAG9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Phf7Q9DAG9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf7Q9DAG9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf7Q9DAG9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf7Q9DAG9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf7Q9DAG9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Phf7Q9DAG9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Phf7Q9DAG9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Phf7Q9DAG9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Phf7Q9DAG9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Phf7Q9DAG9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Phf7Q9DAG9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Phf7Q9DAG9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Phf7Q9DAG9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Phf7Q9DAG9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Phf7Q9DAG9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Phf7Q9DAG9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Phf7Q9DAG9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Phf7Q9DAG9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Phf7Q9DAG9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Phf7Q9DAG9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Phf7Q9DAG9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Phf7Q9DAG9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Phf7Q9DAG9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phf7Q9DAG9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phf7Q9DAG9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phf7Q9DAG9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phf7Q9DAG9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phf7Q9DAG9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phf7Q9DAG9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phf7Q9DAG9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phf7Q9DAG9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phf7Q9DAG9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phf7Q9DAG9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Phf7Q9DAG9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Phf7Q9DAG9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Phf7Q9DAG9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phf7Q9DAG9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phf7Q9DAG9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phf7Q9DAG9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phf7Q9DAG9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phf7Q9DAG9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Phf7Q9DAG9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Phf7Q9DAG9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Phf7Q9DAG9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Phf7Q9DAG9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Phf7Q9DAG9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Phf7Q9DAG9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Phf7Q9DAG9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf7Q9DAG9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf7Q9DAG9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf7Q9DAG9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf7Q9DAG9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf7Q9DAG9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf7Q9DAG9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf7Q9DAG9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf7Q9DAG9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phf7Q9DAG9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phf7Q9DAG9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phf7Q9DAG9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phf7Q9DAG9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Phf7Q9DAG9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phf7Q9DAG9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms