Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Rsph3bQ9DA80 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rsph3bQ9DA80 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rsph3bQ9DA80 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rsph3bQ9DA80 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rsph3bQ9DA80 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rsph3bQ9DA80 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rsph3bQ9DA80 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rsph3bQ9DA80 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rsph3bQ9DA80 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rsph3bQ9DA80 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rsph3bQ9DA80 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rsph3bQ9DA80 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rsph3bQ9DA80 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rsph3bQ9DA80 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rsph3bQ9DA80 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rsph3bQ9DA80 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rsph3bQ9DA80 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rsph3bQ9DA80 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rsph3bQ9DA80 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rsph3bQ9DA80 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rsph3bQ9DA80 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rsph3bQ9DA80 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rsph3bQ9DA80 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rsph3bQ9DA80 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rsph3bQ9DA80 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rsph3bQ9DA80 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rsph3bQ9DA80 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rsph3bQ9DA80 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rsph3bQ9DA80 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rsph3bQ9DA80 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rsph3bQ9DA80 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rsph3bQ9DA80 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rsph3bQ9DA80 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rsph3bQ9DA80 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rsph3bQ9DA80 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rsph3bQ9DA80 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rsph3bQ9DA80 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rsph3bQ9DA80 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rsph3bQ9DA80 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rsph3bQ9DA80 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rsph3bQ9DA80 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rsph3bQ9DA80 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rsph3bQ9DA80 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rsph3bQ9DA80 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rsph3bQ9DA80 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rsph3bQ9DA80 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Rsph3bQ9DA80 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rsph3bQ9DA80 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rsph3bQ9DA80 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rsph3bQ9DA80 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rsph3bQ9DA80 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rsph3bQ9DA80 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rsph3bQ9DA80 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rsph3bQ9DA80 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Rsph3bQ9DA80 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rsph3bQ9DA80 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rsph3bQ9DA80 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rsph3bQ9DA80 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rsph3bQ9DA80 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rsph3bQ9DA80 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rsph3bQ9DA80 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rsph3bQ9DA80 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rsph3bQ9DA80 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsph3bQ9DA80 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsph3bQ9DA80 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsph3bQ9DA80 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsph3bQ9DA80 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsph3bQ9DA80 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rsph3bQ9DA80 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rsph3bQ9DA80 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rsph3bQ9DA80 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rsph3bQ9DA80 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rsph3bQ9DA80 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rsph3bQ9DA80 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rsph3bQ9DA80 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rsph3bQ9DA80 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rsph3bQ9DA80 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rsph3bQ9DA80 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rsph3bQ9DA80 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rsph3bQ9DA80 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rsph3bQ9DA80 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rsph3bQ9DA80 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rsph3bQ9DA80 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rsph3bQ9DA80 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rsph3bQ9DA80 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rsph3bQ9DA80 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rsph3bQ9DA80 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rsph3bQ9DA80 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rsph3bQ9DA80 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rsph3bQ9DA80 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rsph3bQ9DA80 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rsph3bQ9DA80 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rsph3bQ9DA80 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rsph3bQ9DA80 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rsph3bQ9DA80 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rsph3bQ9DA80 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rsph3bQ9DA80 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rsph3bQ9DA80 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rsph3bQ9DA80 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms