Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z1

Knstrn, Small kinetochore-associated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KnstrnQ9D9Z1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KnstrnQ9D9Z1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KnstrnQ9D9Z1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KnstrnQ9D9Z1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KnstrnQ9D9Z1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KnstrnQ9D9Z1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KnstrnQ9D9Z1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KnstrnQ9D9Z1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KnstrnQ9D9Z1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KnstrnQ9D9Z1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KnstrnQ9D9Z1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KnstrnQ9D9Z1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KnstrnQ9D9Z1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KnstrnQ9D9Z1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KnstrnQ9D9Z1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KnstrnQ9D9Z1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KnstrnQ9D9Z1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KnstrnQ9D9Z1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KnstrnQ9D9Z1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KnstrnQ9D9Z1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KnstrnQ9D9Z1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KnstrnQ9D9Z1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KnstrnQ9D9Z1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KnstrnQ9D9Z1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KnstrnQ9D9Z1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KnstrnQ9D9Z1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KnstrnQ9D9Z1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KnstrnQ9D9Z1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KnstrnQ9D9Z1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KnstrnQ9D9Z1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KnstrnQ9D9Z1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KnstrnQ9D9Z1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KnstrnQ9D9Z1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KnstrnQ9D9Z1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KnstrnQ9D9Z1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KnstrnQ9D9Z1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KnstrnQ9D9Z1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KnstrnQ9D9Z1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KnstrnQ9D9Z1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KnstrnQ9D9Z1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KnstrnQ9D9Z1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KnstrnQ9D9Z1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KnstrnQ9D9Z1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KnstrnQ9D9Z1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KnstrnQ9D9Z1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
KnstrnQ9D9Z1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KnstrnQ9D9Z1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KnstrnQ9D9Z1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.53■■■□□ 2
KnstrnQ9D9Z1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KnstrnQ9D9Z1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KnstrnQ9D9Z1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KnstrnQ9D9Z1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KnstrnQ9D9Z1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KnstrnQ9D9Z1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
KnstrnQ9D9Z1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KnstrnQ9D9Z1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KnstrnQ9D9Z1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KnstrnQ9D9Z1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
KnstrnQ9D9Z1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KnstrnQ9D9Z1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KnstrnQ9D9Z1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KnstrnQ9D9Z1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KnstrnQ9D9Z1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
KnstrnQ9D9Z1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KnstrnQ9D9Z1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KnstrnQ9D9Z1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KnstrnQ9D9Z1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KnstrnQ9D9Z1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KnstrnQ9D9Z1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KnstrnQ9D9Z1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KnstrnQ9D9Z1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KnstrnQ9D9Z1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KnstrnQ9D9Z1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KnstrnQ9D9Z1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KnstrnQ9D9Z1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KnstrnQ9D9Z1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KnstrnQ9D9Z1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KnstrnQ9D9Z1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KnstrnQ9D9Z1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
KnstrnQ9D9Z1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KnstrnQ9D9Z1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KnstrnQ9D9Z1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KnstrnQ9D9Z1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KnstrnQ9D9Z1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KnstrnQ9D9Z1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KnstrnQ9D9Z1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KnstrnQ9D9Z1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KnstrnQ9D9Z1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KnstrnQ9D9Z1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KnstrnQ9D9Z1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KnstrnQ9D9Z1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KnstrnQ9D9Z1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KnstrnQ9D9Z1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KnstrnQ9D9Z1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KnstrnQ9D9Z1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KnstrnQ9D9Z1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KnstrnQ9D9Z1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KnstrnQ9D9Z1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KnstrnQ9D9Z1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KnstrnQ9D9Z1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.1 ms