Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9T8

Efhc1, EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc1Q9D9T8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Efhc1Q9D9T8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Efhc1Q9D9T8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efhc1Q9D9T8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efhc1Q9D9T8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efhc1Q9D9T8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efhc1Q9D9T8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efhc1Q9D9T8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efhc1Q9D9T8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efhc1Q9D9T8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efhc1Q9D9T8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efhc1Q9D9T8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efhc1Q9D9T8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efhc1Q9D9T8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efhc1Q9D9T8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efhc1Q9D9T8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efhc1Q9D9T8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efhc1Q9D9T8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efhc1Q9D9T8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efhc1Q9D9T8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efhc1Q9D9T8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efhc1Q9D9T8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Efhc1Q9D9T8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Efhc1Q9D9T8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Efhc1Q9D9T8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efhc1Q9D9T8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efhc1Q9D9T8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efhc1Q9D9T8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efhc1Q9D9T8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Efhc1Q9D9T8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Efhc1Q9D9T8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Efhc1Q9D9T8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Efhc1Q9D9T8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Efhc1Q9D9T8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Efhc1Q9D9T8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Efhc1Q9D9T8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Efhc1Q9D9T8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Efhc1Q9D9T8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Efhc1Q9D9T8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Efhc1Q9D9T8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Efhc1Q9D9T8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Efhc1Q9D9T8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Efhc1Q9D9T8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Efhc1Q9D9T8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Efhc1Q9D9T8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Efhc1Q9D9T8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Efhc1Q9D9T8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Efhc1Q9D9T8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Efhc1Q9D9T8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Efhc1Q9D9T8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Efhc1Q9D9T8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Efhc1Q9D9T8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Efhc1Q9D9T8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Efhc1Q9D9T8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Efhc1Q9D9T8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Efhc1Q9D9T8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Efhc1Q9D9T8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Efhc1Q9D9T8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Efhc1Q9D9T8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Efhc1Q9D9T8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Efhc1Q9D9T8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Efhc1Q9D9T8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Efhc1Q9D9T8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efhc1Q9D9T8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efhc1Q9D9T8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efhc1Q9D9T8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efhc1Q9D9T8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efhc1Q9D9T8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efhc1Q9D9T8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efhc1Q9D9T8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efhc1Q9D9T8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efhc1Q9D9T8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efhc1Q9D9T8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efhc1Q9D9T8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efhc1Q9D9T8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efhc1Q9D9T8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efhc1Q9D9T8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efhc1Q9D9T8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efhc1Q9D9T8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efhc1Q9D9T8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efhc1Q9D9T8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efhc1Q9D9T8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efhc1Q9D9T8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efhc1Q9D9T8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Efhc1Q9D9T8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Efhc1Q9D9T8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Efhc1Q9D9T8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Efhc1Q9D9T8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Efhc1Q9D9T8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Efhc1Q9D9T8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Efhc1Q9D9T8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Efhc1Q9D9T8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Efhc1Q9D9T8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Efhc1Q9D9T8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Efhc1Q9D9T8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Efhc1Q9D9T8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Efhc1Q9D9T8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Efhc1Q9D9T8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Efhc1Q9D9T8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Efhc1Q9D9T8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.2 ms