Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Q6

Calr3, Calreticulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr3Q9D9Q6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Calr3Q9D9Q6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Calr3Q9D9Q6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Calr3Q9D9Q6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Calr3Q9D9Q6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Calr3Q9D9Q6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Calr3Q9D9Q6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Calr3Q9D9Q6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Calr3Q9D9Q6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Calr3Q9D9Q6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Calr3Q9D9Q6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Calr3Q9D9Q6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Calr3Q9D9Q6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Calr3Q9D9Q6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Calr3Q9D9Q6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Calr3Q9D9Q6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Calr3Q9D9Q6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Calr3Q9D9Q6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Calr3Q9D9Q6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Calr3Q9D9Q6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Calr3Q9D9Q6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Calr3Q9D9Q6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Calr3Q9D9Q6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Calr3Q9D9Q6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Calr3Q9D9Q6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Calr3Q9D9Q6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Calr3Q9D9Q6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Calr3Q9D9Q6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Calr3Q9D9Q6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Calr3Q9D9Q6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Calr3Q9D9Q6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Calr3Q9D9Q6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Calr3Q9D9Q6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Calr3Q9D9Q6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Calr3Q9D9Q6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Calr3Q9D9Q6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Calr3Q9D9Q6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Calr3Q9D9Q6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Calr3Q9D9Q6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Calr3Q9D9Q6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Calr3Q9D9Q6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Calr3Q9D9Q6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Calr3Q9D9Q6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Calr3Q9D9Q6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Calr3Q9D9Q6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Calr3Q9D9Q6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Calr3Q9D9Q6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Calr3Q9D9Q6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Calr3Q9D9Q6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Calr3Q9D9Q6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Calr3Q9D9Q6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Calr3Q9D9Q6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Calr3Q9D9Q6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Calr3Q9D9Q6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Calr3Q9D9Q6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Calr3Q9D9Q6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Calr3Q9D9Q6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Calr3Q9D9Q6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Calr3Q9D9Q6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Calr3Q9D9Q6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Calr3Q9D9Q6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Calr3Q9D9Q6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Calr3Q9D9Q6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Calr3Q9D9Q6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Calr3Q9D9Q6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Calr3Q9D9Q6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Calr3Q9D9Q6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Calr3Q9D9Q6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Calr3Q9D9Q6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Calr3Q9D9Q6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Calr3Q9D9Q6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Calr3Q9D9Q6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Calr3Q9D9Q6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Calr3Q9D9Q6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Calr3Q9D9Q6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Calr3Q9D9Q6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Calr3Q9D9Q6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Calr3Q9D9Q6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Calr3Q9D9Q6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Calr3Q9D9Q6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Calr3Q9D9Q6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Calr3Q9D9Q6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Calr3Q9D9Q6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Calr3Q9D9Q6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Calr3Q9D9Q6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Calr3Q9D9Q6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Calr3Q9D9Q6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Calr3Q9D9Q6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Calr3Q9D9Q6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Calr3Q9D9Q6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Calr3Q9D9Q6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Calr3Q9D9Q6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Calr3Q9D9Q6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Calr3Q9D9Q6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Calr3Q9D9Q6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Calr3Q9D9Q6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Calr3Q9D9Q6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Calr3Q9D9Q6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Calr3Q9D9Q6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Calr3Q9D9Q6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms