Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Actrt1Q9D9J3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Actrt1Q9D9J3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Actrt1Q9D9J3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Actrt1Q9D9J3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Actrt1Q9D9J3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Actrt1Q9D9J3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Actrt1Q9D9J3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Actrt1Q9D9J3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Actrt1Q9D9J3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Actrt1Q9D9J3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Actrt1Q9D9J3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Actrt1Q9D9J3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Actrt1Q9D9J3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Actrt1Q9D9J3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Actrt1Q9D9J3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Actrt1Q9D9J3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Actrt1Q9D9J3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Actrt1Q9D9J3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Actrt1Q9D9J3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Actrt1Q9D9J3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Actrt1Q9D9J3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Actrt1Q9D9J3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Actrt1Q9D9J3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Actrt1Q9D9J3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Actrt1Q9D9J3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Actrt1Q9D9J3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Actrt1Q9D9J3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Actrt1Q9D9J3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Actrt1Q9D9J3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Actrt1Q9D9J3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Actrt1Q9D9J3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Actrt1Q9D9J3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Actrt1Q9D9J3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Actrt1Q9D9J3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Actrt1Q9D9J3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Actrt1Q9D9J3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Actrt1Q9D9J3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Actrt1Q9D9J3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Actrt1Q9D9J3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Actrt1Q9D9J3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Actrt1Q9D9J3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Actrt1Q9D9J3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Actrt1Q9D9J3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Actrt1Q9D9J3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Actrt1Q9D9J3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Actrt1Q9D9J3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Actrt1Q9D9J3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Actrt1Q9D9J3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Actrt1Q9D9J3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Actrt1Q9D9J3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Actrt1Q9D9J3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Actrt1Q9D9J3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Actrt1Q9D9J3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Actrt1Q9D9J3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Actrt1Q9D9J3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Actrt1Q9D9J3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Actrt1Q9D9J3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Actrt1Q9D9J3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Actrt1Q9D9J3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Actrt1Q9D9J3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Actrt1Q9D9J3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Actrt1Q9D9J3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Actrt1Q9D9J3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Actrt1Q9D9J3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Actrt1Q9D9J3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Actrt1Q9D9J3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Actrt1Q9D9J3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Actrt1Q9D9J3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Actrt1Q9D9J3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Actrt1Q9D9J3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Actrt1Q9D9J3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Actrt1Q9D9J3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Actrt1Q9D9J3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Actrt1Q9D9J3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Actrt1Q9D9J3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Actrt1Q9D9J3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Actrt1Q9D9J3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Actrt1Q9D9J3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Actrt1Q9D9J3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Actrt1Q9D9J3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Actrt1Q9D9J3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Actrt1Q9D9J3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Actrt1Q9D9J3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Actrt1Q9D9J3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Actrt1Q9D9J3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Actrt1Q9D9J3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Actrt1Q9D9J3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Actrt1Q9D9J3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Actrt1Q9D9J3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Actrt1Q9D9J3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Actrt1Q9D9J3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Actrt1Q9D9J3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Actrt1Q9D9J3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Actrt1Q9D9J3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Actrt1Q9D9J3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Actrt1Q9D9J3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Actrt1Q9D9J3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Actrt1Q9D9J3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Actrt1Q9D9J3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms