Protein–RNA interactions for Protein: Q9D924

Isca1, Iron-sulfur cluster assembly 1 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Isca1Q9D924 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Isca1Q9D924 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Isca1Q9D924 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Isca1Q9D924 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Isca1Q9D924 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Isca1Q9D924 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Isca1Q9D924 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Isca1Q9D924 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Isca1Q9D924 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Isca1Q9D924 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Isca1Q9D924 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Isca1Q9D924 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Isca1Q9D924 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Isca1Q9D924 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Isca1Q9D924 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Isca1Q9D924 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Isca1Q9D924 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Isca1Q9D924 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Isca1Q9D924 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Isca1Q9D924 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Isca1Q9D924 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Isca1Q9D924 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Isca1Q9D924 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Isca1Q9D924 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Isca1Q9D924 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Isca1Q9D924 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Isca1Q9D924 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Isca1Q9D924 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Isca1Q9D924 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Isca1Q9D924 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Isca1Q9D924 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Isca1Q9D924 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Isca1Q9D924 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Isca1Q9D924 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Isca1Q9D924 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Isca1Q9D924 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Isca1Q9D924 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Isca1Q9D924 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Isca1Q9D924 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Isca1Q9D924 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Isca1Q9D924 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Isca1Q9D924 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Isca1Q9D924 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Isca1Q9D924 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Isca1Q9D924 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Isca1Q9D924 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Isca1Q9D924 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Isca1Q9D924 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Isca1Q9D924 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Isca1Q9D924 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Isca1Q9D924 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Isca1Q9D924 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Isca1Q9D924 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Isca1Q9D924 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Isca1Q9D924 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Isca1Q9D924 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Isca1Q9D924 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Isca1Q9D924 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Isca1Q9D924 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Isca1Q9D924 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Isca1Q9D924 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Isca1Q9D924 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Isca1Q9D924 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Isca1Q9D924 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Isca1Q9D924 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Isca1Q9D924 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Isca1Q9D924 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Isca1Q9D924 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Isca1Q9D924 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Isca1Q9D924 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Isca1Q9D924 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Isca1Q9D924 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Isca1Q9D924 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Isca1Q9D924 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Isca1Q9D924 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Isca1Q9D924 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Isca1Q9D924 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Isca1Q9D924 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Isca1Q9D924 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Isca1Q9D924 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Isca1Q9D924 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Isca1Q9D924 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Isca1Q9D924 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Isca1Q9D924 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Isca1Q9D924 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Isca1Q9D924 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Isca1Q9D924 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Isca1Q9D924 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Isca1Q9D924 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Isca1Q9D924 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Isca1Q9D924 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Isca1Q9D924 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Isca1Q9D924 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Isca1Q9D924 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Isca1Q9D924 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Isca1Q9D924 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Isca1Q9D924 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Isca1Q9D924 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Isca1Q9D924 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Isca1Q9D924 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms