Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Y7

Tnfaip8l2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfaip8l2Q9D8Y7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfaip8l2Q9D8Y7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfaip8l2Q9D8Y7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnfaip8l2Q9D8Y7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnfaip8l2Q9D8Y7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfaip8l2Q9D8Y7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnfaip8l2Q9D8Y7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms