Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L0

Uncharacterized protein C11orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8L0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D8L0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D8L0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D8L0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D8L0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D8L0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D8L0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D8L0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D8L0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D8L0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D8L0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D8L0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D8L0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D8L0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D8L0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D8L0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D8L0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D8L0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D8L0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D8L0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D8L0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D8L0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D8L0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D8L0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D8L0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D8L0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D8L0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D8L0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D8L0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D8L0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D8L0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D8L0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D8L0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D8L0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9D8L0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D8L0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D8L0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D8L0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D8L0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D8L0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D8L0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D8L0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D8L0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D8L0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D8L0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D8L0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D8L0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D8L0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D8L0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D8L0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D8L0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D8L0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D8L0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D8L0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D8L0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D8L0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D8L0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D8L0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D8L0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D8L0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D8L0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D8L0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D8L0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D8L0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D8L0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D8L0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D8L0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D8L0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D8L0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D8L0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q9D8L0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D8L0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D8L0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D8L0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D8L0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D8L0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D8L0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D8L0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D8L0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D8L0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D8L0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D8L0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D8L0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D8L0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D8L0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D8L0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D8L0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D8L0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D8L0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D8L0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D8L0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D8L0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D8L0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D8L0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D8L0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D8L0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D8L0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D8L0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D8L0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D8L0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms