Protein–RNA interactions for Protein: Q9D875

2010109A12Rik, MCG1041431, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2010109A12RikQ9D875 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
2010109A12RikQ9D875 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
2010109A12RikQ9D875 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
2010109A12RikQ9D875 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
2010109A12RikQ9D875 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
2010109A12RikQ9D875 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
2010109A12RikQ9D875 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
2010109A12RikQ9D875 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
2010109A12RikQ9D875 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
2010109A12RikQ9D875 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
2010109A12RikQ9D875 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
2010109A12RikQ9D875 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
2010109A12RikQ9D875 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
2010109A12RikQ9D875 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
2010109A12RikQ9D875 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
2010109A12RikQ9D875 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
2010109A12RikQ9D875 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
2010109A12RikQ9D875 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
2010109A12RikQ9D875 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
2010109A12RikQ9D875 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
2010109A12RikQ9D875 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
2010109A12RikQ9D875 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
2010109A12RikQ9D875 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
2010109A12RikQ9D875 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
2010109A12RikQ9D875 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
2010109A12RikQ9D875 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
2010109A12RikQ9D875 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
2010109A12RikQ9D875 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
2010109A12RikQ9D875 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
2010109A12RikQ9D875 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
2010109A12RikQ9D875 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
2010109A12RikQ9D875 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
2010109A12RikQ9D875 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
2010109A12RikQ9D875 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
2010109A12RikQ9D875 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
2010109A12RikQ9D875 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
2010109A12RikQ9D875 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
2010109A12RikQ9D875 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
2010109A12RikQ9D875 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
2010109A12RikQ9D875 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
2010109A12RikQ9D875 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
2010109A12RikQ9D875 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
2010109A12RikQ9D875 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
2010109A12RikQ9D875 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
2010109A12RikQ9D875 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
2010109A12RikQ9D875 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
2010109A12RikQ9D875 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
2010109A12RikQ9D875 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
2010109A12RikQ9D875 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
2010109A12RikQ9D875 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
2010109A12RikQ9D875 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
2010109A12RikQ9D875 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
2010109A12RikQ9D875 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
2010109A12RikQ9D875 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
2010109A12RikQ9D875 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
2010109A12RikQ9D875 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
2010109A12RikQ9D875 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
2010109A12RikQ9D875 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
2010109A12RikQ9D875 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
2010109A12RikQ9D875 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
2010109A12RikQ9D875 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
2010109A12RikQ9D875 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
2010109A12RikQ9D875 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
2010109A12RikQ9D875 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
2010109A12RikQ9D875 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
2010109A12RikQ9D875 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
2010109A12RikQ9D875 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
2010109A12RikQ9D875 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
2010109A12RikQ9D875 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
2010109A12RikQ9D875 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
2010109A12RikQ9D875 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
2010109A12RikQ9D875 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
2010109A12RikQ9D875 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
2010109A12RikQ9D875 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
2010109A12RikQ9D875 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
2010109A12RikQ9D875 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
2010109A12RikQ9D875 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
2010109A12RikQ9D875 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
2010109A12RikQ9D875 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
2010109A12RikQ9D875 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
2010109A12RikQ9D875 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
2010109A12RikQ9D875 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
2010109A12RikQ9D875 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
2010109A12RikQ9D875 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
2010109A12RikQ9D875 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
2010109A12RikQ9D875 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
2010109A12RikQ9D875 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
2010109A12RikQ9D875 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
2010109A12RikQ9D875 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
2010109A12RikQ9D875 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
2010109A12RikQ9D875 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
2010109A12RikQ9D875 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
2010109A12RikQ9D875 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
2010109A12RikQ9D875 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
2010109A12RikQ9D875 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
2010109A12RikQ9D875 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
2010109A12RikQ9D875 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
2010109A12RikQ9D875 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
2010109A12RikQ9D875 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
2010109A12RikQ9D875 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms