Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W5

Med8, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med8Q9D7W5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Med8Q9D7W5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Med8Q9D7W5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Med8Q9D7W5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Med8Q9D7W5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Med8Q9D7W5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Med8Q9D7W5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Med8Q9D7W5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Med8Q9D7W5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Med8Q9D7W5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Med8Q9D7W5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Med8Q9D7W5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Med8Q9D7W5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Med8Q9D7W5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Med8Q9D7W5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Med8Q9D7W5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Med8Q9D7W5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Med8Q9D7W5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Med8Q9D7W5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Med8Q9D7W5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Med8Q9D7W5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Med8Q9D7W5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Med8Q9D7W5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Med8Q9D7W5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Med8Q9D7W5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Med8Q9D7W5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Med8Q9D7W5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Med8Q9D7W5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Med8Q9D7W5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Med8Q9D7W5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Med8Q9D7W5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Med8Q9D7W5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Med8Q9D7W5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Med8Q9D7W5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Med8Q9D7W5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Med8Q9D7W5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Med8Q9D7W5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Med8Q9D7W5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Med8Q9D7W5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Med8Q9D7W5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Med8Q9D7W5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Med8Q9D7W5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Med8Q9D7W5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Med8Q9D7W5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Med8Q9D7W5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Med8Q9D7W5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Med8Q9D7W5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Med8Q9D7W5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Med8Q9D7W5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Med8Q9D7W5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Med8Q9D7W5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Med8Q9D7W5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Med8Q9D7W5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Med8Q9D7W5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Med8Q9D7W5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Med8Q9D7W5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Med8Q9D7W5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Med8Q9D7W5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Med8Q9D7W5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Med8Q9D7W5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Med8Q9D7W5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Med8Q9D7W5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Med8Q9D7W5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Med8Q9D7W5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Med8Q9D7W5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Med8Q9D7W5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Med8Q9D7W5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Med8Q9D7W5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Med8Q9D7W5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Med8Q9D7W5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Med8Q9D7W5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Med8Q9D7W5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Med8Q9D7W5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Med8Q9D7W5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Med8Q9D7W5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Med8Q9D7W5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Med8Q9D7W5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Med8Q9D7W5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Med8Q9D7W5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Med8Q9D7W5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Med8Q9D7W5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Med8Q9D7W5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Med8Q9D7W5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Med8Q9D7W5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Med8Q9D7W5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Med8Q9D7W5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Med8Q9D7W5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Med8Q9D7W5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Med8Q9D7W5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Med8Q9D7W5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Med8Q9D7W5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Med8Q9D7W5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Med8Q9D7W5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Med8Q9D7W5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Med8Q9D7W5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Med8Q9D7W5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Med8Q9D7W5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Med8Q9D7W5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Med8Q9D7W5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Med8Q9D7W5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms