Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmigd1Q9D7L8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmigd1Q9D7L8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmigd1Q9D7L8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmigd1Q9D7L8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmigd1Q9D7L8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmigd1Q9D7L8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmigd1Q9D7L8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmigd1Q9D7L8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmigd1Q9D7L8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmigd1Q9D7L8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmigd1Q9D7L8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmigd1Q9D7L8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmigd1Q9D7L8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmigd1Q9D7L8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmigd1Q9D7L8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmigd1Q9D7L8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmigd1Q9D7L8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tmigd1Q9D7L8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmigd1Q9D7L8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmigd1Q9D7L8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmigd1Q9D7L8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmigd1Q9D7L8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmigd1Q9D7L8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmigd1Q9D7L8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmigd1Q9D7L8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmigd1Q9D7L8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmigd1Q9D7L8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmigd1Q9D7L8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmigd1Q9D7L8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmigd1Q9D7L8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmigd1Q9D7L8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmigd1Q9D7L8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmigd1Q9D7L8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmigd1Q9D7L8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmigd1Q9D7L8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmigd1Q9D7L8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmigd1Q9D7L8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmigd1Q9D7L8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmigd1Q9D7L8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmigd1Q9D7L8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmigd1Q9D7L8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmigd1Q9D7L8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmigd1Q9D7L8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmigd1Q9D7L8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmigd1Q9D7L8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmigd1Q9D7L8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmigd1Q9D7L8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmigd1Q9D7L8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmigd1Q9D7L8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmigd1Q9D7L8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmigd1Q9D7L8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmigd1Q9D7L8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmigd1Q9D7L8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmigd1Q9D7L8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmigd1Q9D7L8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmigd1Q9D7L8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmigd1Q9D7L8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmigd1Q9D7L8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmigd1Q9D7L8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmigd1Q9D7L8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmigd1Q9D7L8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmigd1Q9D7L8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmigd1Q9D7L8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmigd1Q9D7L8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmigd1Q9D7L8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmigd1Q9D7L8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmigd1Q9D7L8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmigd1Q9D7L8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmigd1Q9D7L8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmigd1Q9D7L8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmigd1Q9D7L8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmigd1Q9D7L8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmigd1Q9D7L8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmigd1Q9D7L8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmigd1Q9D7L8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmigd1Q9D7L8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmigd1Q9D7L8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmigd1Q9D7L8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmigd1Q9D7L8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmigd1Q9D7L8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmigd1Q9D7L8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmigd1Q9D7L8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmigd1Q9D7L8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmigd1Q9D7L8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmigd1Q9D7L8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmigd1Q9D7L8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmigd1Q9D7L8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmigd1Q9D7L8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmigd1Q9D7L8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmigd1Q9D7L8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmigd1Q9D7L8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmigd1Q9D7L8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmigd1Q9D7L8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmigd1Q9D7L8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmigd1Q9D7L8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmigd1Q9D7L8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmigd1Q9D7L8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmigd1Q9D7L8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms