Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6X5

Slc52a3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a3Q9D6X5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc52a3Q9D6X5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc52a3Q9D6X5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slc52a3Q9D6X5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc52a3Q9D6X5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc52a3Q9D6X5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc52a3Q9D6X5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc52a3Q9D6X5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc52a3Q9D6X5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc52a3Q9D6X5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc52a3Q9D6X5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc52a3Q9D6X5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc52a3Q9D6X5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc52a3Q9D6X5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc52a3Q9D6X5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc52a3Q9D6X5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc52a3Q9D6X5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc52a3Q9D6X5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc52a3Q9D6X5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc52a3Q9D6X5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc52a3Q9D6X5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc52a3Q9D6X5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc52a3Q9D6X5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc52a3Q9D6X5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc52a3Q9D6X5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc52a3Q9D6X5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc52a3Q9D6X5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc52a3Q9D6X5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc52a3Q9D6X5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc52a3Q9D6X5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc52a3Q9D6X5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc52a3Q9D6X5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc52a3Q9D6X5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc52a3Q9D6X5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc52a3Q9D6X5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Slc52a3Q9D6X5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc52a3Q9D6X5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc52a3Q9D6X5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc52a3Q9D6X5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc52a3Q9D6X5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc52a3Q9D6X5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc52a3Q9D6X5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc52a3Q9D6X5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc52a3Q9D6X5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc52a3Q9D6X5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc52a3Q9D6X5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc52a3Q9D6X5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc52a3Q9D6X5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc52a3Q9D6X5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc52a3Q9D6X5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc52a3Q9D6X5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc52a3Q9D6X5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc52a3Q9D6X5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc52a3Q9D6X5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc52a3Q9D6X5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc52a3Q9D6X5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc52a3Q9D6X5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc52a3Q9D6X5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc52a3Q9D6X5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc52a3Q9D6X5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc52a3Q9D6X5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc52a3Q9D6X5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc52a3Q9D6X5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc52a3Q9D6X5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc52a3Q9D6X5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc52a3Q9D6X5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc52a3Q9D6X5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc52a3Q9D6X5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc52a3Q9D6X5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc52a3Q9D6X5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc52a3Q9D6X5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc52a3Q9D6X5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc52a3Q9D6X5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc52a3Q9D6X5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc52a3Q9D6X5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc52a3Q9D6X5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc52a3Q9D6X5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc52a3Q9D6X5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc52a3Q9D6X5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc52a3Q9D6X5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc52a3Q9D6X5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc52a3Q9D6X5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc52a3Q9D6X5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc52a3Q9D6X5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc52a3Q9D6X5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc52a3Q9D6X5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc52a3Q9D6X5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc52a3Q9D6X5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc52a3Q9D6X5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc52a3Q9D6X5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Slc52a3Q9D6X5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Slc52a3Q9D6X5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc52a3Q9D6X5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc52a3Q9D6X5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc52a3Q9D6X5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc52a3Q9D6X5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc52a3Q9D6X5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc52a3Q9D6X5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc52a3Q9D6X5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc52a3Q9D6X5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms