Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc81Q9D5W4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc81Q9D5W4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc81Q9D5W4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc81Q9D5W4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc81Q9D5W4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc81Q9D5W4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc81Q9D5W4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc81Q9D5W4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc81Q9D5W4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc81Q9D5W4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc81Q9D5W4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc81Q9D5W4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc81Q9D5W4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc81Q9D5W4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc81Q9D5W4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc81Q9D5W4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc81Q9D5W4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc81Q9D5W4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc81Q9D5W4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc81Q9D5W4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc81Q9D5W4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc81Q9D5W4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc81Q9D5W4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc81Q9D5W4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc81Q9D5W4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc81Q9D5W4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc81Q9D5W4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc81Q9D5W4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc81Q9D5W4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc81Q9D5W4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc81Q9D5W4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc81Q9D5W4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc81Q9D5W4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc81Q9D5W4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc81Q9D5W4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc81Q9D5W4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc81Q9D5W4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc81Q9D5W4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc81Q9D5W4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc81Q9D5W4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc81Q9D5W4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc81Q9D5W4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc81Q9D5W4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc81Q9D5W4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc81Q9D5W4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc81Q9D5W4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc81Q9D5W4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc81Q9D5W4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc81Q9D5W4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc81Q9D5W4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc81Q9D5W4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc81Q9D5W4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc81Q9D5W4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc81Q9D5W4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc81Q9D5W4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc81Q9D5W4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc81Q9D5W4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc81Q9D5W4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc81Q9D5W4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc81Q9D5W4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc81Q9D5W4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc81Q9D5W4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc81Q9D5W4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc81Q9D5W4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc81Q9D5W4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc81Q9D5W4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc81Q9D5W4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc81Q9D5W4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc81Q9D5W4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc81Q9D5W4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc81Q9D5W4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc81Q9D5W4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc81Q9D5W4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc81Q9D5W4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc81Q9D5W4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc81Q9D5W4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc81Q9D5W4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc81Q9D5W4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc81Q9D5W4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc81Q9D5W4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc81Q9D5W4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc81Q9D5W4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc81Q9D5W4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc81Q9D5W4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc81Q9D5W4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc81Q9D5W4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc81Q9D5W4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc81Q9D5W4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc81Q9D5W4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc81Q9D5W4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc81Q9D5W4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc81Q9D5W4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc81Q9D5W4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc81Q9D5W4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc81Q9D5W4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc81Q9D5W4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc81Q9D5W4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc81Q9D5W4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms