Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PudpQ9D5U5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PudpQ9D5U5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PudpQ9D5U5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PudpQ9D5U5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PudpQ9D5U5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PudpQ9D5U5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PudpQ9D5U5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PudpQ9D5U5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PudpQ9D5U5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PudpQ9D5U5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PudpQ9D5U5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PudpQ9D5U5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PudpQ9D5U5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PudpQ9D5U5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PudpQ9D5U5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PudpQ9D5U5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PudpQ9D5U5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PudpQ9D5U5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PudpQ9D5U5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PudpQ9D5U5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PudpQ9D5U5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PudpQ9D5U5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PudpQ9D5U5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PudpQ9D5U5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PudpQ9D5U5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PudpQ9D5U5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PudpQ9D5U5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PudpQ9D5U5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PudpQ9D5U5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PudpQ9D5U5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PudpQ9D5U5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PudpQ9D5U5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PudpQ9D5U5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PudpQ9D5U5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PudpQ9D5U5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PudpQ9D5U5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PudpQ9D5U5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PudpQ9D5U5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PudpQ9D5U5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PudpQ9D5U5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PudpQ9D5U5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PudpQ9D5U5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PudpQ9D5U5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PudpQ9D5U5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PudpQ9D5U5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PudpQ9D5U5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PudpQ9D5U5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PudpQ9D5U5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PudpQ9D5U5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PudpQ9D5U5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PudpQ9D5U5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PudpQ9D5U5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PudpQ9D5U5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PudpQ9D5U5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PudpQ9D5U5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PudpQ9D5U5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PudpQ9D5U5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PudpQ9D5U5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PudpQ9D5U5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PudpQ9D5U5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PudpQ9D5U5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PudpQ9D5U5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PudpQ9D5U5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PudpQ9D5U5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PudpQ9D5U5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PudpQ9D5U5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PudpQ9D5U5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PudpQ9D5U5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PudpQ9D5U5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PudpQ9D5U5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PudpQ9D5U5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PudpQ9D5U5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PudpQ9D5U5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PudpQ9D5U5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PudpQ9D5U5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PudpQ9D5U5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PudpQ9D5U5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PudpQ9D5U5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PudpQ9D5U5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PudpQ9D5U5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PudpQ9D5U5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PudpQ9D5U5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PudpQ9D5U5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PudpQ9D5U5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PudpQ9D5U5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PudpQ9D5U5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PudpQ9D5U5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PudpQ9D5U5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PudpQ9D5U5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PudpQ9D5U5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PudpQ9D5U5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PudpQ9D5U5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PudpQ9D5U5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PudpQ9D5U5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PudpQ9D5U5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PudpQ9D5U5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PudpQ9D5U5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PudpQ9D5U5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PudpQ9D5U5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms