Protein–RNA interactions for Protein: Q9D542

4930470P17Rik, RIKEN cDNA 4930470P17, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930470P17RikQ9D542 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930470P17RikQ9D542 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930470P17RikQ9D542 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930470P17RikQ9D542 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930470P17RikQ9D542 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
4930470P17RikQ9D542 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930470P17RikQ9D542 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930470P17RikQ9D542 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930470P17RikQ9D542 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930470P17RikQ9D542 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930470P17RikQ9D542 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930470P17RikQ9D542 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
4930470P17RikQ9D542 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930470P17RikQ9D542 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
4930470P17RikQ9D542 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930470P17RikQ9D542 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930470P17RikQ9D542 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930470P17RikQ9D542 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930470P17RikQ9D542 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930470P17RikQ9D542 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930470P17RikQ9D542 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
4930470P17RikQ9D542 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930470P17RikQ9D542 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
4930470P17RikQ9D542 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930470P17RikQ9D542 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930470P17RikQ9D542 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930470P17RikQ9D542 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930470P17RikQ9D542 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930470P17RikQ9D542 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930470P17RikQ9D542 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930470P17RikQ9D542 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930470P17RikQ9D542 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
4930470P17RikQ9D542 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930470P17RikQ9D542 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930470P17RikQ9D542 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930470P17RikQ9D542 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930470P17RikQ9D542 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930470P17RikQ9D542 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930470P17RikQ9D542 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930470P17RikQ9D542 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930470P17RikQ9D542 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930470P17RikQ9D542 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930470P17RikQ9D542 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930470P17RikQ9D542 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930470P17RikQ9D542 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930470P17RikQ9D542 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930470P17RikQ9D542 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930470P17RikQ9D542 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930470P17RikQ9D542 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930470P17RikQ9D542 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930470P17RikQ9D542 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930470P17RikQ9D542 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930470P17RikQ9D542 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930470P17RikQ9D542 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930470P17RikQ9D542 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930470P17RikQ9D542 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930470P17RikQ9D542 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930470P17RikQ9D542 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930470P17RikQ9D542 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930470P17RikQ9D542 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930470P17RikQ9D542 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930470P17RikQ9D542 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930470P17RikQ9D542 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930470P17RikQ9D542 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930470P17RikQ9D542 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930470P17RikQ9D542 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930470P17RikQ9D542 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930470P17RikQ9D542 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930470P17RikQ9D542 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930470P17RikQ9D542 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930470P17RikQ9D542 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930470P17RikQ9D542 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930470P17RikQ9D542 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930470P17RikQ9D542 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930470P17RikQ9D542 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930470P17RikQ9D542 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930470P17RikQ9D542 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930470P17RikQ9D542 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930470P17RikQ9D542 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930470P17RikQ9D542 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930470P17RikQ9D542 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930470P17RikQ9D542 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930470P17RikQ9D542 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930470P17RikQ9D542 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930470P17RikQ9D542 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930470P17RikQ9D542 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930470P17RikQ9D542 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930470P17RikQ9D542 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930470P17RikQ9D542 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930470P17RikQ9D542 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930470P17RikQ9D542 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930470P17RikQ9D542 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930470P17RikQ9D542 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930470P17RikQ9D542 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
4930470P17RikQ9D542 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
4930470P17RikQ9D542 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930470P17RikQ9D542 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930470P17RikQ9D542 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930470P17RikQ9D542 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
4930470P17RikQ9D542 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms