Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9D4W2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9D4W2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9D4W2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9D4W2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9D4W2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9D4W2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9D4W2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9D4W2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9D4W2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9D4W2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q9D4W2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9D4W2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9D4W2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9D4W2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9D4W2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9D4W2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9D4W2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q9D4W2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D4W2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D4W2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D4W2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D4W2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D4W2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D4W2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D4W2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D4W2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D4W2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q9D4W2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9D4W2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9D4W2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q9D4W2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Q9D4W2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q9D4W2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9D4W2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9D4W2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9D4W2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q9D4W2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9D4W2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9D4W2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9D4W2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9D4W2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Q9D4W2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D4W2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q9D4W2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D4W2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D4W2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D4W2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q9D4W2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D4W2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D4W2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D4W2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D4W2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D4W2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D4W2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D4W2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9D4W2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9D4W2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9D4W2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9D4W2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9D4W2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9D4W2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9D4W2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9D4W2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9D4W2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9D4W2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q9D4W2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q9D4W2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q9D4W2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D4W2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D4W2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D4W2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D4W2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D4W2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D4W2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D4W2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D4W2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D4W2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D4W2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D4W2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D4W2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D4W2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D4W2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D4W2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D4W2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D4W2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D4W2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D4W2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9D4W2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9D4W2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9D4W2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9D4W2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9D4W2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9D4W2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9D4W2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9D4W2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9D4W2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9D4W2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9D4W2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9D4W2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms