Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc105Q9D4K7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc105Q9D4K7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc105Q9D4K7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc105Q9D4K7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc105Q9D4K7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc105Q9D4K7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc105Q9D4K7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc105Q9D4K7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc105Q9D4K7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc105Q9D4K7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc105Q9D4K7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc105Q9D4K7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc105Q9D4K7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc105Q9D4K7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc105Q9D4K7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc105Q9D4K7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc105Q9D4K7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc105Q9D4K7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc105Q9D4K7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc105Q9D4K7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc105Q9D4K7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc105Q9D4K7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc105Q9D4K7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc105Q9D4K7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc105Q9D4K7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc105Q9D4K7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc105Q9D4K7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc105Q9D4K7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc105Q9D4K7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc105Q9D4K7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc105Q9D4K7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc105Q9D4K7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc105Q9D4K7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc105Q9D4K7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc105Q9D4K7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc105Q9D4K7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc105Q9D4K7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc105Q9D4K7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc105Q9D4K7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc105Q9D4K7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc105Q9D4K7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc105Q9D4K7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc105Q9D4K7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc105Q9D4K7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc105Q9D4K7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc105Q9D4K7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc105Q9D4K7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc105Q9D4K7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc105Q9D4K7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc105Q9D4K7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc105Q9D4K7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc105Q9D4K7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc105Q9D4K7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc105Q9D4K7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc105Q9D4K7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc105Q9D4K7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc105Q9D4K7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc105Q9D4K7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc105Q9D4K7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc105Q9D4K7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc105Q9D4K7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc105Q9D4K7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc105Q9D4K7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc105Q9D4K7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc105Q9D4K7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc105Q9D4K7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc105Q9D4K7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms