Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J9

4931423N10Rik, MCG52616, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931423N10RikQ9D4J9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4931423N10RikQ9D4J9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4931423N10RikQ9D4J9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4931423N10RikQ9D4J9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4931423N10RikQ9D4J9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
4931423N10RikQ9D4J9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4931423N10RikQ9D4J9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4931423N10RikQ9D4J9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4931423N10RikQ9D4J9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4931423N10RikQ9D4J9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
4931423N10RikQ9D4J9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4931423N10RikQ9D4J9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4931423N10RikQ9D4J9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4931423N10RikQ9D4J9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
4931423N10RikQ9D4J9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4931423N10RikQ9D4J9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
4931423N10RikQ9D4J9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4931423N10RikQ9D4J9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
4931423N10RikQ9D4J9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4931423N10RikQ9D4J9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
4931423N10RikQ9D4J9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4931423N10RikQ9D4J9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4931423N10RikQ9D4J9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
4931423N10RikQ9D4J9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
4931423N10RikQ9D4J9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
4931423N10RikQ9D4J9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
4931423N10RikQ9D4J9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
4931423N10RikQ9D4J9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
4931423N10RikQ9D4J9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4931423N10RikQ9D4J9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4931423N10RikQ9D4J9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
4931423N10RikQ9D4J9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
4931423N10RikQ9D4J9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
4931423N10RikQ9D4J9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
4931423N10RikQ9D4J9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4931423N10RikQ9D4J9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
4931423N10RikQ9D4J9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4931423N10RikQ9D4J9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4931423N10RikQ9D4J9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4931423N10RikQ9D4J9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4931423N10RikQ9D4J9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
4931423N10RikQ9D4J9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
4931423N10RikQ9D4J9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
4931423N10RikQ9D4J9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
4931423N10RikQ9D4J9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4931423N10RikQ9D4J9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4931423N10RikQ9D4J9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4931423N10RikQ9D4J9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4931423N10RikQ9D4J9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
4931423N10RikQ9D4J9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4931423N10RikQ9D4J9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
4931423N10RikQ9D4J9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
4931423N10RikQ9D4J9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
4931423N10RikQ9D4J9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
4931423N10RikQ9D4J9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4931423N10RikQ9D4J9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4931423N10RikQ9D4J9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4931423N10RikQ9D4J9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4931423N10RikQ9D4J9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
4931423N10RikQ9D4J9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
4931423N10RikQ9D4J9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4931423N10RikQ9D4J9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4931423N10RikQ9D4J9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
4931423N10RikQ9D4J9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
4931423N10RikQ9D4J9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
4931423N10RikQ9D4J9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
4931423N10RikQ9D4J9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
4931423N10RikQ9D4J9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
4931423N10RikQ9D4J9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
4931423N10RikQ9D4J9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
4931423N10RikQ9D4J9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
4931423N10RikQ9D4J9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4931423N10RikQ9D4J9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
4931423N10RikQ9D4J9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4931423N10RikQ9D4J9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4931423N10RikQ9D4J9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4931423N10RikQ9D4J9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4931423N10RikQ9D4J9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4931423N10RikQ9D4J9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4931423N10RikQ9D4J9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4931423N10RikQ9D4J9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
4931423N10RikQ9D4J9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4931423N10RikQ9D4J9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4931423N10RikQ9D4J9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
4931423N10RikQ9D4J9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
4931423N10RikQ9D4J9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4931423N10RikQ9D4J9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4931423N10RikQ9D4J9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
4931423N10RikQ9D4J9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4931423N10RikQ9D4J9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4931423N10RikQ9D4J9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
4931423N10RikQ9D4J9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4931423N10RikQ9D4J9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4931423N10RikQ9D4J9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
4931423N10RikQ9D4J9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
4931423N10RikQ9D4J9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4931423N10RikQ9D4J9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4931423N10RikQ9D4J9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4931423N10RikQ9D4J9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms