Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lonrf3Q9D4H7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lonrf3Q9D4H7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lonrf3Q9D4H7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Lonrf3Q9D4H7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lonrf3Q9D4H7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lonrf3Q9D4H7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lonrf3Q9D4H7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lonrf3Q9D4H7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lonrf3Q9D4H7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lonrf3Q9D4H7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lonrf3Q9D4H7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lonrf3Q9D4H7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lonrf3Q9D4H7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lonrf3Q9D4H7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lonrf3Q9D4H7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lonrf3Q9D4H7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lonrf3Q9D4H7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lonrf3Q9D4H7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lonrf3Q9D4H7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lonrf3Q9D4H7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lonrf3Q9D4H7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lonrf3Q9D4H7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lonrf3Q9D4H7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lonrf3Q9D4H7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lonrf3Q9D4H7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lonrf3Q9D4H7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lonrf3Q9D4H7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lonrf3Q9D4H7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lonrf3Q9D4H7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lonrf3Q9D4H7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lonrf3Q9D4H7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lonrf3Q9D4H7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lonrf3Q9D4H7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lonrf3Q9D4H7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lonrf3Q9D4H7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lonrf3Q9D4H7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lonrf3Q9D4H7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lonrf3Q9D4H7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lonrf3Q9D4H7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lonrf3Q9D4H7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lonrf3Q9D4H7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lonrf3Q9D4H7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lonrf3Q9D4H7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lonrf3Q9D4H7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lonrf3Q9D4H7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lonrf3Q9D4H7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Lonrf3Q9D4H7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lonrf3Q9D4H7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lonrf3Q9D4H7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lonrf3Q9D4H7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lonrf3Q9D4H7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Lonrf3Q9D4H7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lonrf3Q9D4H7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lonrf3Q9D4H7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lonrf3Q9D4H7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lonrf3Q9D4H7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lonrf3Q9D4H7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lonrf3Q9D4H7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lonrf3Q9D4H7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lonrf3Q9D4H7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lonrf3Q9D4H7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lonrf3Q9D4H7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lonrf3Q9D4H7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lonrf3Q9D4H7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lonrf3Q9D4H7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lonrf3Q9D4H7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lonrf3Q9D4H7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lonrf3Q9D4H7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lonrf3Q9D4H7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lonrf3Q9D4H7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lonrf3Q9D4H7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lonrf3Q9D4H7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lonrf3Q9D4H7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lonrf3Q9D4H7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lonrf3Q9D4H7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lonrf3Q9D4H7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lonrf3Q9D4H7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lonrf3Q9D4H7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lonrf3Q9D4H7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lonrf3Q9D4H7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lonrf3Q9D4H7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lonrf3Q9D4H7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lonrf3Q9D4H7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lonrf3Q9D4H7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lonrf3Q9D4H7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lonrf3Q9D4H7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lonrf3Q9D4H7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lonrf3Q9D4H7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Lonrf3Q9D4H7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lonrf3Q9D4H7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lonrf3Q9D4H7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lonrf3Q9D4H7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lonrf3Q9D4H7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lonrf3Q9D4H7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lonrf3Q9D4H7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lonrf3Q9D4H7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lonrf3Q9D4H7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lonrf3Q9D4H7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lonrf3Q9D4H7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms