Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D5

4933414I15Rik, RIKEN cDNA 4933414I15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933414I15RikQ9D4D5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933414I15RikQ9D4D5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933414I15RikQ9D4D5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933414I15RikQ9D4D5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933414I15RikQ9D4D5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933414I15RikQ9D4D5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4933414I15RikQ9D4D5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933414I15RikQ9D4D5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933414I15RikQ9D4D5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933414I15RikQ9D4D5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4933414I15RikQ9D4D5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4933414I15RikQ9D4D5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4933414I15RikQ9D4D5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4933414I15RikQ9D4D5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4933414I15RikQ9D4D5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4933414I15RikQ9D4D5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4933414I15RikQ9D4D5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4933414I15RikQ9D4D5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
4933414I15RikQ9D4D5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
4933414I15RikQ9D4D5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4933414I15RikQ9D4D5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4933414I15RikQ9D4D5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4933414I15RikQ9D4D5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4933414I15RikQ9D4D5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933414I15RikQ9D4D5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933414I15RikQ9D4D5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933414I15RikQ9D4D5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
4933414I15RikQ9D4D5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933414I15RikQ9D4D5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933414I15RikQ9D4D5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933414I15RikQ9D4D5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933414I15RikQ9D4D5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933414I15RikQ9D4D5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933414I15RikQ9D4D5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933414I15RikQ9D4D5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933414I15RikQ9D4D5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933414I15RikQ9D4D5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933414I15RikQ9D4D5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933414I15RikQ9D4D5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933414I15RikQ9D4D5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933414I15RikQ9D4D5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933414I15RikQ9D4D5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933414I15RikQ9D4D5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933414I15RikQ9D4D5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933414I15RikQ9D4D5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933414I15RikQ9D4D5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
4933414I15RikQ9D4D5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933414I15RikQ9D4D5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933414I15RikQ9D4D5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933414I15RikQ9D4D5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
4933414I15RikQ9D4D5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
4933414I15RikQ9D4D5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933414I15RikQ9D4D5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933414I15RikQ9D4D5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933414I15RikQ9D4D5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933414I15RikQ9D4D5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933414I15RikQ9D4D5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933414I15RikQ9D4D5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933414I15RikQ9D4D5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933414I15RikQ9D4D5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933414I15RikQ9D4D5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4933414I15RikQ9D4D5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4933414I15RikQ9D4D5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4933414I15RikQ9D4D5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
4933414I15RikQ9D4D5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933414I15RikQ9D4D5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933414I15RikQ9D4D5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933414I15RikQ9D4D5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933414I15RikQ9D4D5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4933414I15RikQ9D4D5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
4933414I15RikQ9D4D5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933414I15RikQ9D4D5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933414I15RikQ9D4D5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933414I15RikQ9D4D5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
4933414I15RikQ9D4D5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933414I15RikQ9D4D5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4933414I15RikQ9D4D5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933414I15RikQ9D4D5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
4933414I15RikQ9D4D5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933414I15RikQ9D4D5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
4933414I15RikQ9D4D5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933414I15RikQ9D4D5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933414I15RikQ9D4D5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933414I15RikQ9D4D5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933414I15RikQ9D4D5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933414I15RikQ9D4D5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4933414I15RikQ9D4D5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4933414I15RikQ9D4D5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4933414I15RikQ9D4D5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4933414I15RikQ9D4D5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4933414I15RikQ9D4D5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
4933414I15RikQ9D4D5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
4933414I15RikQ9D4D5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4933414I15RikQ9D4D5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4933414I15RikQ9D4D5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
4933414I15RikQ9D4D5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
4933414I15RikQ9D4D5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
4933414I15RikQ9D4D5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4933414I15RikQ9D4D5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4933414I15RikQ9D4D5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms