Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sohlh2Q9D489 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sohlh2Q9D489 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sohlh2Q9D489 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sohlh2Q9D489 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sohlh2Q9D489 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sohlh2Q9D489 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sohlh2Q9D489 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sohlh2Q9D489 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sohlh2Q9D489 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sohlh2Q9D489 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sohlh2Q9D489 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sohlh2Q9D489 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Sohlh2Q9D489 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sohlh2Q9D489 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sohlh2Q9D489 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sohlh2Q9D489 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sohlh2Q9D489 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sohlh2Q9D489 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sohlh2Q9D489 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sohlh2Q9D489 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sohlh2Q9D489 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sohlh2Q9D489 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sohlh2Q9D489 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sohlh2Q9D489 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Sohlh2Q9D489 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sohlh2Q9D489 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sohlh2Q9D489 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sohlh2Q9D489 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sohlh2Q9D489 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Sohlh2Q9D489 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sohlh2Q9D489 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sohlh2Q9D489 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sohlh2Q9D489 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sohlh2Q9D489 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sohlh2Q9D489 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sohlh2Q9D489 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sohlh2Q9D489 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sohlh2Q9D489 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sohlh2Q9D489 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sohlh2Q9D489 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sohlh2Q9D489 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sohlh2Q9D489 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sohlh2Q9D489 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sohlh2Q9D489 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sohlh2Q9D489 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sohlh2Q9D489 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sohlh2Q9D489 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sohlh2Q9D489 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sohlh2Q9D489 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sohlh2Q9D489 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sohlh2Q9D489 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sohlh2Q9D489 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sohlh2Q9D489 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sohlh2Q9D489 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sohlh2Q9D489 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sohlh2Q9D489 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sohlh2Q9D489 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sohlh2Q9D489 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sohlh2Q9D489 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sohlh2Q9D489 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sohlh2Q9D489 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sohlh2Q9D489 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sohlh2Q9D489 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sohlh2Q9D489 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sohlh2Q9D489 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sohlh2Q9D489 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sohlh2Q9D489 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sohlh2Q9D489 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sohlh2Q9D489 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sohlh2Q9D489 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sohlh2Q9D489 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sohlh2Q9D489 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sohlh2Q9D489 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sohlh2Q9D489 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sohlh2Q9D489 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sohlh2Q9D489 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sohlh2Q9D489 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sohlh2Q9D489 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sohlh2Q9D489 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sohlh2Q9D489 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sohlh2Q9D489 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sohlh2Q9D489 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sohlh2Q9D489 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sohlh2Q9D489 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sohlh2Q9D489 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sohlh2Q9D489 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sohlh2Q9D489 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sohlh2Q9D489 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Sohlh2Q9D489 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Sohlh2Q9D489 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sohlh2Q9D489 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sohlh2Q9D489 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sohlh2Q9D489 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sohlh2Q9D489 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sohlh2Q9D489 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sohlh2Q9D489 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sohlh2Q9D489 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sohlh2Q9D489 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sohlh2Q9D489 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms