Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
4933428G20RikQ9D3X4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms