Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9D2Q3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9D2Q3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9D2Q3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9D2Q3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9D2Q3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9D2Q3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9D2Q3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q9D2Q3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q9D2Q3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9D2Q3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9D2Q3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9D2Q3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9D2Q3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9D2Q3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q9D2Q3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q9D2Q3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q9D2Q3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q9D2Q3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q9D2Q3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Q9D2Q3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Q9D2Q3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Q9D2Q3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Q9D2Q3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q9D2Q3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q9D2Q3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q9D2Q3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q9D2Q3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q9D2Q3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9D2Q3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9D2Q3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9D2Q3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9D2Q3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9D2Q3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9D2Q3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9D2Q3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9D2Q3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9D2Q3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q9D2Q3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q9D2Q3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9D2Q3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9D2Q3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9D2Q3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9D2Q3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9D2Q3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q9D2Q3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9D2Q3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9D2Q3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q9D2Q3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9D2Q3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9D2Q3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9D2Q3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q9D2Q3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q9D2Q3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q9D2Q3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q9D2Q3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q9D2Q3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q9D2Q3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Q9D2Q3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9D2Q3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9D2Q3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9D2Q3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9D2Q3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9D2Q3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9D2Q3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q9D2Q3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Q9D2Q3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Q9D2Q3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Q9D2Q3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Q9D2Q3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q9D2Q3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q9D2Q3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q9D2Q3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q9D2Q3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q9D2Q3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q9D2Q3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9D2Q3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9D2Q3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q9D2Q3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q9D2Q3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q9D2Q3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q9D2Q3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q9D2Q3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q9D2Q3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9D2Q3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q9D2Q3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9D2Q3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q9D2Q3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q9D2Q3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q9D2Q3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q9D2Q3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q9D2Q3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q9D2Q3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Q9D2Q3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q9D2Q3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q9D2Q3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Q9D2Q3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q9D2Q3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q9D2Q3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q9D2Q3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms