Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Batf3Q9D275 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Batf3Q9D275 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Batf3Q9D275 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Batf3Q9D275 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Batf3Q9D275 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Batf3Q9D275 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Batf3Q9D275 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Batf3Q9D275 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Batf3Q9D275 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Batf3Q9D275 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Batf3Q9D275 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Batf3Q9D275 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Batf3Q9D275 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Batf3Q9D275 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Batf3Q9D275 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Batf3Q9D275 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Batf3Q9D275 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Batf3Q9D275 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Batf3Q9D275 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Batf3Q9D275 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Batf3Q9D275 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Batf3Q9D275 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Batf3Q9D275 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Batf3Q9D275 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Batf3Q9D275 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Batf3Q9D275 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Batf3Q9D275 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Batf3Q9D275 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Batf3Q9D275 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Batf3Q9D275 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Batf3Q9D275 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Batf3Q9D275 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Batf3Q9D275 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Batf3Q9D275 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Batf3Q9D275 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Batf3Q9D275 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Batf3Q9D275 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Batf3Q9D275 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Batf3Q9D275 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Batf3Q9D275 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Batf3Q9D275 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Batf3Q9D275 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Batf3Q9D275 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Batf3Q9D275 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Batf3Q9D275 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Batf3Q9D275 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Batf3Q9D275 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Batf3Q9D275 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Batf3Q9D275 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Batf3Q9D275 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Batf3Q9D275 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Batf3Q9D275 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Batf3Q9D275 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Batf3Q9D275 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Batf3Q9D275 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Batf3Q9D275 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Batf3Q9D275 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Batf3Q9D275 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Batf3Q9D275 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Batf3Q9D275 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Batf3Q9D275 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Batf3Q9D275 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Batf3Q9D275 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Batf3Q9D275 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Batf3Q9D275 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Batf3Q9D275 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Batf3Q9D275 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Batf3Q9D275 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Batf3Q9D275 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Batf3Q9D275 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Batf3Q9D275 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Batf3Q9D275 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Batf3Q9D275 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Batf3Q9D275 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Batf3Q9D275 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Batf3Q9D275 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Batf3Q9D275 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Batf3Q9D275 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Batf3Q9D275 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Batf3Q9D275 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Batf3Q9D275 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Batf3Q9D275 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Batf3Q9D275 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Batf3Q9D275 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Batf3Q9D275 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Batf3Q9D275 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Batf3Q9D275 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Batf3Q9D275 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Batf3Q9D275 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Batf3Q9D275 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Batf3Q9D275 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Batf3Q9D275 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Batf3Q9D275 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Batf3Q9D275 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Batf3Q9D275 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Batf3Q9D275 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Batf3Q9D275 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Batf3Q9D275 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Batf3Q9D275 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms