Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Krtap5-3Q9D226 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Krtap5-3Q9D226 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Krtap5-3Q9D226 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krtap5-3Q9D226 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krtap5-3Q9D226 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Krtap5-3Q9D226 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krtap5-3Q9D226 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krtap5-3Q9D226 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krtap5-3Q9D226 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krtap5-3Q9D226 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krtap5-3Q9D226 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krtap5-3Q9D226 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krtap5-3Q9D226 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krtap5-3Q9D226 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krtap5-3Q9D226 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krtap5-3Q9D226 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krtap5-3Q9D226 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krtap5-3Q9D226 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Krtap5-3Q9D226 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krtap5-3Q9D226 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krtap5-3Q9D226 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krtap5-3Q9D226 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krtap5-3Q9D226 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krtap5-3Q9D226 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krtap5-3Q9D226 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Krtap5-3Q9D226 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Krtap5-3Q9D226 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Krtap5-3Q9D226 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Krtap5-3Q9D226 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krtap5-3Q9D226 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krtap5-3Q9D226 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krtap5-3Q9D226 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krtap5-3Q9D226 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Krtap5-3Q9D226 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Krtap5-3Q9D226 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krtap5-3Q9D226 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krtap5-3Q9D226 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krtap5-3Q9D226 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Krtap5-3Q9D226 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krtap5-3Q9D226 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krtap5-3Q9D226 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krtap5-3Q9D226 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krtap5-3Q9D226 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krtap5-3Q9D226 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krtap5-3Q9D226 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krtap5-3Q9D226 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krtap5-3Q9D226 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krtap5-3Q9D226 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Krtap5-3Q9D226 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krtap5-3Q9D226 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krtap5-3Q9D226 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krtap5-3Q9D226 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krtap5-3Q9D226 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krtap5-3Q9D226 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krtap5-3Q9D226 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krtap5-3Q9D226 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krtap5-3Q9D226 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krtap5-3Q9D226 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krtap5-3Q9D226 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krtap5-3Q9D226 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krtap5-3Q9D226 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krtap5-3Q9D226 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krtap5-3Q9D226 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krtap5-3Q9D226 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krtap5-3Q9D226 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krtap5-3Q9D226 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krtap5-3Q9D226 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krtap5-3Q9D226 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krtap5-3Q9D226 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krtap5-3Q9D226 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krtap5-3Q9D226 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krtap5-3Q9D226 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krtap5-3Q9D226 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krtap5-3Q9D226 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krtap5-3Q9D226 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krtap5-3Q9D226 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krtap5-3Q9D226 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krtap5-3Q9D226 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krtap5-3Q9D226 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krtap5-3Q9D226 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krtap5-3Q9D226 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Krtap5-3Q9D226 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krtap5-3Q9D226 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krtap5-3Q9D226 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krtap5-3Q9D226 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krtap5-3Q9D226 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krtap5-3Q9D226 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krtap5-3Q9D226 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krtap5-3Q9D226 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Krtap5-3Q9D226 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krtap5-3Q9D226 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krtap5-3Q9D226 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krtap5-3Q9D226 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krtap5-3Q9D226 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krtap5-3Q9D226 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krtap5-3Q9D226 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krtap5-3Q9D226 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krtap5-3Q9D226 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krtap5-3Q9D226 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110 ms