Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M2

Cdca7, Cell division cycle-associated protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca7Q9D0M2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdca7Q9D0M2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdca7Q9D0M2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdca7Q9D0M2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdca7Q9D0M2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdca7Q9D0M2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdca7Q9D0M2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdca7Q9D0M2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdca7Q9D0M2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdca7Q9D0M2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdca7Q9D0M2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdca7Q9D0M2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdca7Q9D0M2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cdca7Q9D0M2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdca7Q9D0M2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdca7Q9D0M2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cdca7Q9D0M2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cdca7Q9D0M2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cdca7Q9D0M2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cdca7Q9D0M2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cdca7Q9D0M2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cdca7Q9D0M2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdca7Q9D0M2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdca7Q9D0M2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdca7Q9D0M2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdca7Q9D0M2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdca7Q9D0M2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdca7Q9D0M2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdca7Q9D0M2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdca7Q9D0M2 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdca7Q9D0M2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdca7Q9D0M2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdca7Q9D0M2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdca7Q9D0M2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdca7Q9D0M2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdca7Q9D0M2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdca7Q9D0M2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdca7Q9D0M2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdca7Q9D0M2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdca7Q9D0M2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdca7Q9D0M2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdca7Q9D0M2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdca7Q9D0M2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdca7Q9D0M2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdca7Q9D0M2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdca7Q9D0M2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdca7Q9D0M2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdca7Q9D0M2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdca7Q9D0M2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdca7Q9D0M2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdca7Q9D0M2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdca7Q9D0M2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdca7Q9D0M2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdca7Q9D0M2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdca7Q9D0M2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdca7Q9D0M2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdca7Q9D0M2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdca7Q9D0M2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdca7Q9D0M2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdca7Q9D0M2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdca7Q9D0M2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdca7Q9D0M2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdca7Q9D0M2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdca7Q9D0M2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdca7Q9D0M2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdca7Q9D0M2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdca7Q9D0M2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdca7Q9D0M2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdca7Q9D0M2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdca7Q9D0M2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdca7Q9D0M2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdca7Q9D0M2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdca7Q9D0M2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdca7Q9D0M2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdca7Q9D0M2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdca7Q9D0M2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdca7Q9D0M2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdca7Q9D0M2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdca7Q9D0M2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdca7Q9D0M2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdca7Q9D0M2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdca7Q9D0M2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdca7Q9D0M2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdca7Q9D0M2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdca7Q9D0M2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdca7Q9D0M2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdca7Q9D0M2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdca7Q9D0M2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdca7Q9D0M2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdca7Q9D0M2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdca7Q9D0M2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdca7Q9D0M2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdca7Q9D0M2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdca7Q9D0M2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdca7Q9D0M2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdca7Q9D0M2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdca7Q9D0M2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdca7Q9D0M2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdca7Q9D0M2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdca7Q9D0M2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms