Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Gtf2e1Q9D0D5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Gtf2e1Q9D0D5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Gtf2e1Q9D0D5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Gtf2e1Q9D0D5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Gtf2e1Q9D0D5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Gtf2e1Q9D0D5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Gtf2e1Q9D0D5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Gtf2e1Q9D0D5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Gtf2e1Q9D0D5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Gtf2e1Q9D0D5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Gtf2e1Q9D0D5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Gtf2e1Q9D0D5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Gtf2e1Q9D0D5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Gtf2e1Q9D0D5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Gtf2e1Q9D0D5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Gtf2e1Q9D0D5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Gtf2e1Q9D0D5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
Gtf2e1Q9D0D5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Gtf2e1Q9D0D5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Gtf2e1Q9D0D5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Gtf2e1Q9D0D5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Gtf2e1Q9D0D5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Gtf2e1Q9D0D5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Gtf2e1Q9D0D5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Gtf2e1Q9D0D5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Gtf2e1Q9D0D5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Gtf2e1Q9D0D5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Gtf2e1Q9D0D5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Gtf2e1Q9D0D5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Gtf2e1Q9D0D5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Gtf2e1Q9D0D5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
Gtf2e1Q9D0D5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Gtf2e1Q9D0D5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Gtf2e1Q9D0D5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Gtf2e1Q9D0D5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Gtf2e1Q9D0D5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Gtf2e1Q9D0D5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Gtf2e1Q9D0D5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Gtf2e1Q9D0D5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Gtf2e1Q9D0D5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Gtf2e1Q9D0D5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Gtf2e1Q9D0D5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Gtf2e1Q9D0D5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Gtf2e1Q9D0D5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Gtf2e1Q9D0D5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Gtf2e1Q9D0D5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Gtf2e1Q9D0D5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Gtf2e1Q9D0D5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Gtf2e1Q9D0D5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Gtf2e1Q9D0D5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Gtf2e1Q9D0D5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Gtf2e1Q9D0D5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Gtf2e1Q9D0D5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Gtf2e1Q9D0D5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Gtf2e1Q9D0D5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Gtf2e1Q9D0D5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Gtf2e1Q9D0D5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Gtf2e1Q9D0D5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Gtf2e1Q9D0D5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Gtf2e1Q9D0D5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Gtf2e1Q9D0D5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Gtf2e1Q9D0D5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Gtf2e1Q9D0D5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Gtf2e1Q9D0D5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Gtf2e1Q9D0D5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Gtf2e1Q9D0D5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Gtf2e1Q9D0D5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Gtf2e1Q9D0D5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Gtf2e1Q9D0D5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Gtf2e1Q9D0D5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Gtf2e1Q9D0D5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Gtf2e1Q9D0D5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Gtf2e1Q9D0D5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Gtf2e1Q9D0D5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Gtf2e1Q9D0D5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Gtf2e1Q9D0D5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.57
Gtf2e1Q9D0D5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Gtf2e1Q9D0D5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Gtf2e1Q9D0D5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Gtf2e1Q9D0D5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Gtf2e1Q9D0D5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Gtf2e1Q9D0D5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Gtf2e1Q9D0D5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms