Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shmt2Q9CZN7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shmt2Q9CZN7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shmt2Q9CZN7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shmt2Q9CZN7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shmt2Q9CZN7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shmt2Q9CZN7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shmt2Q9CZN7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shmt2Q9CZN7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shmt2Q9CZN7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Shmt2Q9CZN7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shmt2Q9CZN7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shmt2Q9CZN7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shmt2Q9CZN7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shmt2Q9CZN7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shmt2Q9CZN7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shmt2Q9CZN7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shmt2Q9CZN7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shmt2Q9CZN7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shmt2Q9CZN7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shmt2Q9CZN7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shmt2Q9CZN7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shmt2Q9CZN7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shmt2Q9CZN7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shmt2Q9CZN7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shmt2Q9CZN7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Shmt2Q9CZN7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shmt2Q9CZN7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shmt2Q9CZN7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shmt2Q9CZN7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shmt2Q9CZN7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shmt2Q9CZN7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shmt2Q9CZN7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shmt2Q9CZN7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shmt2Q9CZN7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shmt2Q9CZN7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shmt2Q9CZN7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shmt2Q9CZN7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shmt2Q9CZN7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shmt2Q9CZN7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Shmt2Q9CZN7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Shmt2Q9CZN7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Shmt2Q9CZN7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shmt2Q9CZN7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shmt2Q9CZN7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Shmt2Q9CZN7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Shmt2Q9CZN7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shmt2Q9CZN7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Shmt2Q9CZN7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shmt2Q9CZN7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Shmt2Q9CZN7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Shmt2Q9CZN7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Shmt2Q9CZN7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Shmt2Q9CZN7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Shmt2Q9CZN7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Shmt2Q9CZN7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Shmt2Q9CZN7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Shmt2Q9CZN7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Shmt2Q9CZN7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Shmt2Q9CZN7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Shmt2Q9CZN7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Shmt2Q9CZN7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Shmt2Q9CZN7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shmt2Q9CZN7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shmt2Q9CZN7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Shmt2Q9CZN7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shmt2Q9CZN7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Shmt2Q9CZN7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Shmt2Q9CZN7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Shmt2Q9CZN7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Shmt2Q9CZN7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Shmt2Q9CZN7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Shmt2Q9CZN7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Shmt2Q9CZN7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Shmt2Q9CZN7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Shmt2Q9CZN7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Shmt2Q9CZN7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Shmt2Q9CZN7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Shmt2Q9CZN7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Shmt2Q9CZN7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Shmt2Q9CZN7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Shmt2Q9CZN7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Shmt2Q9CZN7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Shmt2Q9CZN7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Shmt2Q9CZN7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Shmt2Q9CZN7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Shmt2Q9CZN7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Shmt2Q9CZN7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Shmt2Q9CZN7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Shmt2Q9CZN7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Shmt2Q9CZN7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Shmt2Q9CZN7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Shmt2Q9CZN7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Shmt2Q9CZN7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Shmt2Q9CZN7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Shmt2Q9CZN7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Shmt2Q9CZN7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Shmt2Q9CZN7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Shmt2Q9CZN7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Shmt2Q9CZN7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 225.2 ms