Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snf8Q9CZ28 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snf8Q9CZ28 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snf8Q9CZ28 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snf8Q9CZ28 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snf8Q9CZ28 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snf8Q9CZ28 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snf8Q9CZ28 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snf8Q9CZ28 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snf8Q9CZ28 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snf8Q9CZ28 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snf8Q9CZ28 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snf8Q9CZ28 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snf8Q9CZ28 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snf8Q9CZ28 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snf8Q9CZ28 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snf8Q9CZ28 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snf8Q9CZ28 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snf8Q9CZ28 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snf8Q9CZ28 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snf8Q9CZ28 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snf8Q9CZ28 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snf8Q9CZ28 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snf8Q9CZ28 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Snf8Q9CZ28 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snf8Q9CZ28 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snf8Q9CZ28 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snf8Q9CZ28 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snf8Q9CZ28 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snf8Q9CZ28 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snf8Q9CZ28 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snf8Q9CZ28 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Snf8Q9CZ28 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Snf8Q9CZ28 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snf8Q9CZ28 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snf8Q9CZ28 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snf8Q9CZ28 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snf8Q9CZ28 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snf8Q9CZ28 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snf8Q9CZ28 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snf8Q9CZ28 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snf8Q9CZ28 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snf8Q9CZ28 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snf8Q9CZ28 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snf8Q9CZ28 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snf8Q9CZ28 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snf8Q9CZ28 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snf8Q9CZ28 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snf8Q9CZ28 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snf8Q9CZ28 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snf8Q9CZ28 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snf8Q9CZ28 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snf8Q9CZ28 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snf8Q9CZ28 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snf8Q9CZ28 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snf8Q9CZ28 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snf8Q9CZ28 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snf8Q9CZ28 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snf8Q9CZ28 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snf8Q9CZ28 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snf8Q9CZ28 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snf8Q9CZ28 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snf8Q9CZ28 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snf8Q9CZ28 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snf8Q9CZ28 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snf8Q9CZ28 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snf8Q9CZ28 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snf8Q9CZ28 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snf8Q9CZ28 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snf8Q9CZ28 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snf8Q9CZ28 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snf8Q9CZ28 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snf8Q9CZ28 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snf8Q9CZ28 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Snf8Q9CZ28 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snf8Q9CZ28 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snf8Q9CZ28 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Snf8Q9CZ28 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snf8Q9CZ28 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snf8Q9CZ28 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snf8Q9CZ28 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snf8Q9CZ28 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snf8Q9CZ28 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snf8Q9CZ28 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snf8Q9CZ28 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snf8Q9CZ28 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snf8Q9CZ28 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snf8Q9CZ28 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snf8Q9CZ28 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snf8Q9CZ28 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snf8Q9CZ28 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snf8Q9CZ28 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snf8Q9CZ28 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snf8Q9CZ28 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snf8Q9CZ28 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snf8Q9CZ28 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snf8Q9CZ28 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snf8Q9CZ28 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snf8Q9CZ28 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Snf8Q9CZ28 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms