Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChtopQ9CY57 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChtopQ9CY57 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChtopQ9CY57 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ChtopQ9CY57 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChtopQ9CY57 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ChtopQ9CY57 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChtopQ9CY57 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChtopQ9CY57 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChtopQ9CY57 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChtopQ9CY57 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ChtopQ9CY57 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChtopQ9CY57 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChtopQ9CY57 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChtopQ9CY57 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ChtopQ9CY57 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChtopQ9CY57 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChtopQ9CY57 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChtopQ9CY57 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChtopQ9CY57 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChtopQ9CY57 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChtopQ9CY57 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChtopQ9CY57 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChtopQ9CY57 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChtopQ9CY57 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChtopQ9CY57 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChtopQ9CY57 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChtopQ9CY57 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChtopQ9CY57 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChtopQ9CY57 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChtopQ9CY57 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChtopQ9CY57 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChtopQ9CY57 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChtopQ9CY57 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChtopQ9CY57 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChtopQ9CY57 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChtopQ9CY57 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChtopQ9CY57 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ChtopQ9CY57 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChtopQ9CY57 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChtopQ9CY57 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChtopQ9CY57 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChtopQ9CY57 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChtopQ9CY57 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChtopQ9CY57 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChtopQ9CY57 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChtopQ9CY57 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChtopQ9CY57 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChtopQ9CY57 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChtopQ9CY57 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChtopQ9CY57 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChtopQ9CY57 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChtopQ9CY57 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChtopQ9CY57 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChtopQ9CY57 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChtopQ9CY57 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChtopQ9CY57 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChtopQ9CY57 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChtopQ9CY57 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChtopQ9CY57 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChtopQ9CY57 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChtopQ9CY57 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChtopQ9CY57 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChtopQ9CY57 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChtopQ9CY57 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChtopQ9CY57 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChtopQ9CY57 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChtopQ9CY57 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChtopQ9CY57 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChtopQ9CY57 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChtopQ9CY57 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChtopQ9CY57 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChtopQ9CY57 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChtopQ9CY57 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChtopQ9CY57 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChtopQ9CY57 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChtopQ9CY57 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChtopQ9CY57 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChtopQ9CY57 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChtopQ9CY57 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChtopQ9CY57 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChtopQ9CY57 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ChtopQ9CY57 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ChtopQ9CY57 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChtopQ9CY57 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ChtopQ9CY57 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChtopQ9CY57 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ChtopQ9CY57 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChtopQ9CY57 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChtopQ9CY57 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChtopQ9CY57 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ChtopQ9CY57 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChtopQ9CY57 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChtopQ9CY57 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChtopQ9CY57 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ChtopQ9CY57 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChtopQ9CY57 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ChtopQ9CY57 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChtopQ9CY57 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ChtopQ9CY57 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms