Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY50

Ssr1, Translocon-associated protein subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr1Q9CY50 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ssr1Q9CY50 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ssr1Q9CY50 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ssr1Q9CY50 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ssr1Q9CY50 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ssr1Q9CY50 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ssr1Q9CY50 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ssr1Q9CY50 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ssr1Q9CY50 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ssr1Q9CY50 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ssr1Q9CY50 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ssr1Q9CY50 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ssr1Q9CY50 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ssr1Q9CY50 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ssr1Q9CY50 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ssr1Q9CY50 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ssr1Q9CY50 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ssr1Q9CY50 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ssr1Q9CY50 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ssr1Q9CY50 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ssr1Q9CY50 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ssr1Q9CY50 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ssr1Q9CY50 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ssr1Q9CY50 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ssr1Q9CY50 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ssr1Q9CY50 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ssr1Q9CY50 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ssr1Q9CY50 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ssr1Q9CY50 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ssr1Q9CY50 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ssr1Q9CY50 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ssr1Q9CY50 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ssr1Q9CY50 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ssr1Q9CY50 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ssr1Q9CY50 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ssr1Q9CY50 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ssr1Q9CY50 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ssr1Q9CY50 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ssr1Q9CY50 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ssr1Q9CY50 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ssr1Q9CY50 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ssr1Q9CY50 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ssr1Q9CY50 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ssr1Q9CY50 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ssr1Q9CY50 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ssr1Q9CY50 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ssr1Q9CY50 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ssr1Q9CY50 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ssr1Q9CY50 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ssr1Q9CY50 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ssr1Q9CY50 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ssr1Q9CY50 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ssr1Q9CY50 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ssr1Q9CY50 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ssr1Q9CY50 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ssr1Q9CY50 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ssr1Q9CY50 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ssr1Q9CY50 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ssr1Q9CY50 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ssr1Q9CY50 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ssr1Q9CY50 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ssr1Q9CY50 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ssr1Q9CY50 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ssr1Q9CY50 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ssr1Q9CY50 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ssr1Q9CY50 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ssr1Q9CY50 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Ssr1Q9CY50 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ssr1Q9CY50 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ssr1Q9CY50 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ssr1Q9CY50 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ssr1Q9CY50 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ssr1Q9CY50 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ssr1Q9CY50 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ssr1Q9CY50 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ssr1Q9CY50 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ssr1Q9CY50 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ssr1Q9CY50 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ssr1Q9CY50 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ssr1Q9CY50 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ssr1Q9CY50 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ssr1Q9CY50 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ssr1Q9CY50 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ssr1Q9CY50 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ssr1Q9CY50 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ssr1Q9CY50 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ssr1Q9CY50 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ssr1Q9CY50 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ssr1Q9CY50 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ssr1Q9CY50 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ssr1Q9CY50 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ssr1Q9CY50 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ssr1Q9CY50 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ssr1Q9CY50 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ssr1Q9CY50 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ssr1Q9CY50 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ssr1Q9CY50 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ssr1Q9CY50 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ssr1Q9CY50 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ssr1Q9CY50 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms