Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xrcc3Q9CXE6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xrcc3Q9CXE6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xrcc3Q9CXE6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xrcc3Q9CXE6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xrcc3Q9CXE6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xrcc3Q9CXE6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xrcc3Q9CXE6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xrcc3Q9CXE6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xrcc3Q9CXE6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xrcc3Q9CXE6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xrcc3Q9CXE6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xrcc3Q9CXE6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xrcc3Q9CXE6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xrcc3Q9CXE6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xrcc3Q9CXE6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xrcc3Q9CXE6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Xrcc3Q9CXE6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xrcc3Q9CXE6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xrcc3Q9CXE6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xrcc3Q9CXE6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xrcc3Q9CXE6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xrcc3Q9CXE6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xrcc3Q9CXE6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xrcc3Q9CXE6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Xrcc3Q9CXE6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xrcc3Q9CXE6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Xrcc3Q9CXE6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xrcc3Q9CXE6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xrcc3Q9CXE6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xrcc3Q9CXE6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xrcc3Q9CXE6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xrcc3Q9CXE6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xrcc3Q9CXE6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xrcc3Q9CXE6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xrcc3Q9CXE6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xrcc3Q9CXE6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xrcc3Q9CXE6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xrcc3Q9CXE6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xrcc3Q9CXE6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xrcc3Q9CXE6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xrcc3Q9CXE6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xrcc3Q9CXE6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xrcc3Q9CXE6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xrcc3Q9CXE6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xrcc3Q9CXE6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xrcc3Q9CXE6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xrcc3Q9CXE6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xrcc3Q9CXE6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xrcc3Q9CXE6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xrcc3Q9CXE6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xrcc3Q9CXE6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xrcc3Q9CXE6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xrcc3Q9CXE6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Xrcc3Q9CXE6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Xrcc3Q9CXE6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Xrcc3Q9CXE6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Xrcc3Q9CXE6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Xrcc3Q9CXE6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Xrcc3Q9CXE6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Xrcc3Q9CXE6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xrcc3Q9CXE6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xrcc3Q9CXE6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Xrcc3Q9CXE6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xrcc3Q9CXE6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xrcc3Q9CXE6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xrcc3Q9CXE6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xrcc3Q9CXE6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xrcc3Q9CXE6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Xrcc3Q9CXE6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xrcc3Q9CXE6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xrcc3Q9CXE6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xrcc3Q9CXE6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xrcc3Q9CXE6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xrcc3Q9CXE6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Xrcc3Q9CXE6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xrcc3Q9CXE6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xrcc3Q9CXE6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xrcc3Q9CXE6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xrcc3Q9CXE6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xrcc3Q9CXE6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xrcc3Q9CXE6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Xrcc3Q9CXE6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xrcc3Q9CXE6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xrcc3Q9CXE6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xrcc3Q9CXE6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Xrcc3Q9CXE6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Xrcc3Q9CXE6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Xrcc3Q9CXE6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Xrcc3Q9CXE6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Xrcc3Q9CXE6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Xrcc3Q9CXE6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xrcc3Q9CXE6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xrcc3Q9CXE6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Xrcc3Q9CXE6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xrcc3Q9CXE6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Xrcc3Q9CXE6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Xrcc3Q9CXE6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms