Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Prkrip1Q9CWV6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Prkrip1Q9CWV6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Prkrip1Q9CWV6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Prkrip1Q9CWV6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Prkrip1Q9CWV6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Prkrip1Q9CWV6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Prkrip1Q9CWV6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Prkrip1Q9CWV6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Prkrip1Q9CWV6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Prkrip1Q9CWV6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Prkrip1Q9CWV6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Prkrip1Q9CWV6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Prkrip1Q9CWV6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Prkrip1Q9CWV6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Prkrip1Q9CWV6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Prkrip1Q9CWV6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Prkrip1Q9CWV6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Prkrip1Q9CWV6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Prkrip1Q9CWV6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Prkrip1Q9CWV6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Prkrip1Q9CWV6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Prkrip1Q9CWV6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Prkrip1Q9CWV6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Prkrip1Q9CWV6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Prkrip1Q9CWV6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Prkrip1Q9CWV6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Prkrip1Q9CWV6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Prkrip1Q9CWV6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Prkrip1Q9CWV6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Prkrip1Q9CWV6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Prkrip1Q9CWV6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Prkrip1Q9CWV6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Prkrip1Q9CWV6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Prkrip1Q9CWV6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Prkrip1Q9CWV6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prkrip1Q9CWV6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prkrip1Q9CWV6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prkrip1Q9CWV6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prkrip1Q9CWV6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Prkrip1Q9CWV6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Prkrip1Q9CWV6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Prkrip1Q9CWV6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Prkrip1Q9CWV6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Prkrip1Q9CWV6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Prkrip1Q9CWV6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Prkrip1Q9CWV6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Prkrip1Q9CWV6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prkrip1Q9CWV6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prkrip1Q9CWV6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prkrip1Q9CWV6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prkrip1Q9CWV6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Prkrip1Q9CWV6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Prkrip1Q9CWV6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Prkrip1Q9CWV6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Prkrip1Q9CWV6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prkrip1Q9CWV6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prkrip1Q9CWV6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prkrip1Q9CWV6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prkrip1Q9CWV6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Prkrip1Q9CWV6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Prkrip1Q9CWV6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Prkrip1Q9CWV6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Prkrip1Q9CWV6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prkrip1Q9CWV6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prkrip1Q9CWV6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prkrip1Q9CWV6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prkrip1Q9CWV6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prkrip1Q9CWV6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prkrip1Q9CWV6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prkrip1Q9CWV6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prkrip1Q9CWV6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prkrip1Q9CWV6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prkrip1Q9CWV6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prkrip1Q9CWV6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prkrip1Q9CWV6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prkrip1Q9CWV6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prkrip1Q9CWV6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Prkrip1Q9CWV6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Prkrip1Q9CWV6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Prkrip1Q9CWV6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Prkrip1Q9CWV6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Prkrip1Q9CWV6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prkrip1Q9CWV6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prkrip1Q9CWV6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prkrip1Q9CWV6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prkrip1Q9CWV6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prkrip1Q9CWV6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Prkrip1Q9CWV6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Prkrip1Q9CWV6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Prkrip1Q9CWV6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Prkrip1Q9CWV6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prkrip1Q9CWV6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prkrip1Q9CWV6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Prkrip1Q9CWV6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Prkrip1Q9CWV6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Prkrip1Q9CWV6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Prkrip1Q9CWV6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Prkrip1Q9CWV6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prkrip1Q9CWV6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms