Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9CWU4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9CWU4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9CWU4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9CWU4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9CWU4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9CWU4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9CWU4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9CWU4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9CWU4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9CWU4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9CWU4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9CWU4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9CWU4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9CWU4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9CWU4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9CWU4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9CWU4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q9CWU4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q9CWU4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9CWU4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9CWU4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9CWU4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9CWU4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9CWU4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9CWU4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9CWU4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9CWU4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9CWU4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9CWU4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9CWU4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9CWU4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9CWU4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9CWU4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9CWU4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9CWU4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9CWU4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9CWU4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9CWU4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9CWU4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9CWU4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9CWU4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9CWU4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9CWU4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9CWU4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9CWU4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9CWU4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9CWU4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9CWU4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9CWU4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9CWU4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9CWU4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9CWU4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9CWU4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9CWU4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9CWU4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9CWU4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9CWU4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9CWU4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9CWU4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9CWU4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9CWU4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Q9CWU4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9CWU4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9CWU4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9CWU4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9CWU4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9CWU4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9CWU4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9CWU4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9CWU4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9CWU4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9CWU4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9CWU4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9CWU4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9CWU4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9CWU4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9CWU4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9CWU4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9CWU4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9CWU4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9CWU4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9CWU4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9CWU4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9CWU4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9CWU4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9CWU4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9CWU4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9CWU4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9CWU4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9CWU4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9CWU4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9CWU4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9CWU4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9CWU4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9CWU4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9CWU4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9CWU4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9CWU4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9CWU4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms