Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWF2

Tubb2b, Tubulin beta-2B chain, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb2bQ9CWF2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tubb2bQ9CWF2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tubb2bQ9CWF2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tubb2bQ9CWF2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tubb2bQ9CWF2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tubb2bQ9CWF2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubb2bQ9CWF2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubb2bQ9CWF2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubb2bQ9CWF2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tubb2bQ9CWF2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tubb2bQ9CWF2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tubb2bQ9CWF2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tubb2bQ9CWF2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tubb2bQ9CWF2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tubb2bQ9CWF2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tubb2bQ9CWF2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tubb2bQ9CWF2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tubb2bQ9CWF2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tubb2bQ9CWF2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tubb2bQ9CWF2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tubb2bQ9CWF2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tubb2bQ9CWF2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tubb2bQ9CWF2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tubb2bQ9CWF2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tubb2bQ9CWF2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tubb2bQ9CWF2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tubb2bQ9CWF2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tubb2bQ9CWF2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tubb2bQ9CWF2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tubb2bQ9CWF2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tubb2bQ9CWF2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tubb2bQ9CWF2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tubb2bQ9CWF2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tubb2bQ9CWF2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tubb2bQ9CWF2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tubb2bQ9CWF2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tubb2bQ9CWF2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tubb2bQ9CWF2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tubb2bQ9CWF2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tubb2bQ9CWF2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubb2bQ9CWF2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubb2bQ9CWF2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubb2bQ9CWF2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubb2bQ9CWF2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tubb2bQ9CWF2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tubb2bQ9CWF2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tubb2bQ9CWF2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tubb2bQ9CWF2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tubb2bQ9CWF2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubb2bQ9CWF2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubb2bQ9CWF2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubb2bQ9CWF2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubb2bQ9CWF2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubb2bQ9CWF2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubb2bQ9CWF2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubb2bQ9CWF2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubb2bQ9CWF2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubb2bQ9CWF2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubb2bQ9CWF2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubb2bQ9CWF2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tubb2bQ9CWF2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tubb2bQ9CWF2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tubb2bQ9CWF2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tubb2bQ9CWF2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tubb2bQ9CWF2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tubb2bQ9CWF2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tubb2bQ9CWF2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tubb2bQ9CWF2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tubb2bQ9CWF2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tubb2bQ9CWF2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tubb2bQ9CWF2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tubb2bQ9CWF2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tubb2bQ9CWF2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tubb2bQ9CWF2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tubb2bQ9CWF2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tubb2bQ9CWF2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tubb2bQ9CWF2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tubb2bQ9CWF2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tubb2bQ9CWF2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tubb2bQ9CWF2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tubb2bQ9CWF2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tubb2bQ9CWF2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tubb2bQ9CWF2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tubb2bQ9CWF2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubb2bQ9CWF2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubb2bQ9CWF2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubb2bQ9CWF2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tubb2bQ9CWF2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tubb2bQ9CWF2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubb2bQ9CWF2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubb2bQ9CWF2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubb2bQ9CWF2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tubb2bQ9CWF2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tubb2bQ9CWF2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tubb2bQ9CWF2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tubb2bQ9CWF2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tubb2bQ9CWF2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tubb2bQ9CWF2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Tubb2bQ9CWF2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tubb2bQ9CWF2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms