Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sppl3Q9CUS9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sppl3Q9CUS9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sppl3Q9CUS9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sppl3Q9CUS9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sppl3Q9CUS9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sppl3Q9CUS9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sppl3Q9CUS9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sppl3Q9CUS9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Sppl3Q9CUS9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sppl3Q9CUS9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sppl3Q9CUS9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sppl3Q9CUS9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sppl3Q9CUS9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sppl3Q9CUS9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sppl3Q9CUS9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sppl3Q9CUS9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sppl3Q9CUS9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sppl3Q9CUS9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sppl3Q9CUS9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sppl3Q9CUS9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sppl3Q9CUS9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sppl3Q9CUS9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sppl3Q9CUS9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sppl3Q9CUS9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sppl3Q9CUS9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Sppl3Q9CUS9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sppl3Q9CUS9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sppl3Q9CUS9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sppl3Q9CUS9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Sppl3Q9CUS9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sppl3Q9CUS9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sppl3Q9CUS9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sppl3Q9CUS9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Sppl3Q9CUS9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sppl3Q9CUS9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sppl3Q9CUS9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Sppl3Q9CUS9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sppl3Q9CUS9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sppl3Q9CUS9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sppl3Q9CUS9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sppl3Q9CUS9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sppl3Q9CUS9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Sppl3Q9CUS9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sppl3Q9CUS9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sppl3Q9CUS9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sppl3Q9CUS9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sppl3Q9CUS9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sppl3Q9CUS9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sppl3Q9CUS9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sppl3Q9CUS9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Sppl3Q9CUS9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Sppl3Q9CUS9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sppl3Q9CUS9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sppl3Q9CUS9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sppl3Q9CUS9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sppl3Q9CUS9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sppl3Q9CUS9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sppl3Q9CUS9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sppl3Q9CUS9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sppl3Q9CUS9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Sppl3Q9CUS9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sppl3Q9CUS9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sppl3Q9CUS9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sppl3Q9CUS9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sppl3Q9CUS9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sppl3Q9CUS9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sppl3Q9CUS9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sppl3Q9CUS9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sppl3Q9CUS9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Sppl3Q9CUS9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sppl3Q9CUS9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sppl3Q9CUS9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sppl3Q9CUS9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sppl3Q9CUS9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sppl3Q9CUS9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sppl3Q9CUS9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sppl3Q9CUS9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sppl3Q9CUS9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sppl3Q9CUS9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sppl3Q9CUS9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sppl3Q9CUS9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sppl3Q9CUS9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sppl3Q9CUS9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sppl3Q9CUS9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sppl3Q9CUS9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sppl3Q9CUS9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sppl3Q9CUS9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Sppl3Q9CUS9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sppl3Q9CUS9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sppl3Q9CUS9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sppl3Q9CUS9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sppl3Q9CUS9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sppl3Q9CUS9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sppl3Q9CUS9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sppl3Q9CUS9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sppl3Q9CUS9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sppl3Q9CUS9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Sppl3Q9CUS9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sppl3Q9CUS9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms