Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC9

Gnpda2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda2Q9CRC9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gnpda2Q9CRC9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gnpda2Q9CRC9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gnpda2Q9CRC9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gnpda2Q9CRC9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gnpda2Q9CRC9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gnpda2Q9CRC9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gnpda2Q9CRC9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gnpda2Q9CRC9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gnpda2Q9CRC9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gnpda2Q9CRC9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gnpda2Q9CRC9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gnpda2Q9CRC9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gnpda2Q9CRC9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gnpda2Q9CRC9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gnpda2Q9CRC9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gnpda2Q9CRC9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gnpda2Q9CRC9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gnpda2Q9CRC9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gnpda2Q9CRC9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gnpda2Q9CRC9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gnpda2Q9CRC9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gnpda2Q9CRC9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gnpda2Q9CRC9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gnpda2Q9CRC9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gnpda2Q9CRC9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gnpda2Q9CRC9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gnpda2Q9CRC9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gnpda2Q9CRC9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gnpda2Q9CRC9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gnpda2Q9CRC9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gnpda2Q9CRC9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gnpda2Q9CRC9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gnpda2Q9CRC9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gnpda2Q9CRC9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gnpda2Q9CRC9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gnpda2Q9CRC9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gnpda2Q9CRC9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gnpda2Q9CRC9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gnpda2Q9CRC9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gnpda2Q9CRC9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gnpda2Q9CRC9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gnpda2Q9CRC9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gnpda2Q9CRC9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gnpda2Q9CRC9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gnpda2Q9CRC9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gnpda2Q9CRC9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gnpda2Q9CRC9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gnpda2Q9CRC9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gnpda2Q9CRC9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gnpda2Q9CRC9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gnpda2Q9CRC9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gnpda2Q9CRC9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gnpda2Q9CRC9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gnpda2Q9CRC9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gnpda2Q9CRC9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gnpda2Q9CRC9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gnpda2Q9CRC9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gnpda2Q9CRC9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gnpda2Q9CRC9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gnpda2Q9CRC9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gnpda2Q9CRC9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gnpda2Q9CRC9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gnpda2Q9CRC9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gnpda2Q9CRC9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gnpda2Q9CRC9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gnpda2Q9CRC9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gnpda2Q9CRC9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gnpda2Q9CRC9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gnpda2Q9CRC9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gnpda2Q9CRC9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gnpda2Q9CRC9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gnpda2Q9CRC9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gnpda2Q9CRC9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gnpda2Q9CRC9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gnpda2Q9CRC9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gnpda2Q9CRC9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gnpda2Q9CRC9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gnpda2Q9CRC9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gnpda2Q9CRC9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gnpda2Q9CRC9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gnpda2Q9CRC9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gnpda2Q9CRC9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gnpda2Q9CRC9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gnpda2Q9CRC9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gnpda2Q9CRC9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gnpda2Q9CRC9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gnpda2Q9CRC9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gnpda2Q9CRC9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gnpda2Q9CRC9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gnpda2Q9CRC9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gnpda2Q9CRC9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gnpda2Q9CRC9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gnpda2Q9CRC9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gnpda2Q9CRC9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gnpda2Q9CRC9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gnpda2Q9CRC9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gnpda2Q9CRC9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gnpda2Q9CRC9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gnpda2Q9CRC9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms