Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQV6

Map1lc3b, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3B, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map1lc3bQ9CQV6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Map1lc3bQ9CQV6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Map1lc3bQ9CQV6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Map1lc3bQ9CQV6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Map1lc3bQ9CQV6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Map1lc3bQ9CQV6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Map1lc3bQ9CQV6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Map1lc3bQ9CQV6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Map1lc3bQ9CQV6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Map1lc3bQ9CQV6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Map1lc3bQ9CQV6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Map1lc3bQ9CQV6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Map1lc3bQ9CQV6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Map1lc3bQ9CQV6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Map1lc3bQ9CQV6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Map1lc3bQ9CQV6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Map1lc3bQ9CQV6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Map1lc3bQ9CQV6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Map1lc3bQ9CQV6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Map1lc3bQ9CQV6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Map1lc3bQ9CQV6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Map1lc3bQ9CQV6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Map1lc3bQ9CQV6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Map1lc3bQ9CQV6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Map1lc3bQ9CQV6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Map1lc3bQ9CQV6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Map1lc3bQ9CQV6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Map1lc3bQ9CQV6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Map1lc3bQ9CQV6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Map1lc3bQ9CQV6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Map1lc3bQ9CQV6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Map1lc3bQ9CQV6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Map1lc3bQ9CQV6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Map1lc3bQ9CQV6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Map1lc3bQ9CQV6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Map1lc3bQ9CQV6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Map1lc3bQ9CQV6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Map1lc3bQ9CQV6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Map1lc3bQ9CQV6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Map1lc3bQ9CQV6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Map1lc3bQ9CQV6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Map1lc3bQ9CQV6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Map1lc3bQ9CQV6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Map1lc3bQ9CQV6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Map1lc3bQ9CQV6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Map1lc3bQ9CQV6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Map1lc3bQ9CQV6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Map1lc3bQ9CQV6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Map1lc3bQ9CQV6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Map1lc3bQ9CQV6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Map1lc3bQ9CQV6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Map1lc3bQ9CQV6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Map1lc3bQ9CQV6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Map1lc3bQ9CQV6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Map1lc3bQ9CQV6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Map1lc3bQ9CQV6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Map1lc3bQ9CQV6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Map1lc3bQ9CQV6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Map1lc3bQ9CQV6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Map1lc3bQ9CQV6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Map1lc3bQ9CQV6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Map1lc3bQ9CQV6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Map1lc3bQ9CQV6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Map1lc3bQ9CQV6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Map1lc3bQ9CQV6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Map1lc3bQ9CQV6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Map1lc3bQ9CQV6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Map1lc3bQ9CQV6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Map1lc3bQ9CQV6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Map1lc3bQ9CQV6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Map1lc3bQ9CQV6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Map1lc3bQ9CQV6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Map1lc3bQ9CQV6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Map1lc3bQ9CQV6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Map1lc3bQ9CQV6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Map1lc3bQ9CQV6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Map1lc3bQ9CQV6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Map1lc3bQ9CQV6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Map1lc3bQ9CQV6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Map1lc3bQ9CQV6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Map1lc3bQ9CQV6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Map1lc3bQ9CQV6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Map1lc3bQ9CQV6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Map1lc3bQ9CQV6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Map1lc3bQ9CQV6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Map1lc3bQ9CQV6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Map1lc3bQ9CQV6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Map1lc3bQ9CQV6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Map1lc3bQ9CQV6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Map1lc3bQ9CQV6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Map1lc3bQ9CQV6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Map1lc3bQ9CQV6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Map1lc3bQ9CQV6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Map1lc3bQ9CQV6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Map1lc3bQ9CQV6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Map1lc3bQ9CQV6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Map1lc3bQ9CQV6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Map1lc3bQ9CQV6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Map1lc3bQ9CQV6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Map1lc3bQ9CQV6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms