Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQV4

Retreg3, Reticulophagy regulator 3, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Retreg3Q9CQV4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retreg3Q9CQV4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retreg3Q9CQV4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retreg3Q9CQV4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retreg3Q9CQV4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retreg3Q9CQV4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retreg3Q9CQV4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retreg3Q9CQV4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retreg3Q9CQV4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retreg3Q9CQV4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retreg3Q9CQV4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retreg3Q9CQV4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retreg3Q9CQV4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retreg3Q9CQV4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retreg3Q9CQV4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retreg3Q9CQV4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retreg3Q9CQV4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retreg3Q9CQV4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retreg3Q9CQV4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retreg3Q9CQV4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retreg3Q9CQV4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retreg3Q9CQV4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retreg3Q9CQV4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retreg3Q9CQV4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retreg3Q9CQV4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retreg3Q9CQV4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retreg3Q9CQV4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retreg3Q9CQV4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retreg3Q9CQV4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retreg3Q9CQV4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retreg3Q9CQV4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retreg3Q9CQV4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retreg3Q9CQV4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retreg3Q9CQV4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retreg3Q9CQV4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retreg3Q9CQV4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retreg3Q9CQV4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retreg3Q9CQV4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retreg3Q9CQV4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retreg3Q9CQV4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retreg3Q9CQV4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retreg3Q9CQV4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retreg3Q9CQV4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retreg3Q9CQV4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retreg3Q9CQV4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retreg3Q9CQV4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retreg3Q9CQV4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retreg3Q9CQV4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retreg3Q9CQV4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retreg3Q9CQV4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retreg3Q9CQV4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retreg3Q9CQV4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retreg3Q9CQV4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retreg3Q9CQV4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retreg3Q9CQV4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retreg3Q9CQV4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retreg3Q9CQV4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retreg3Q9CQV4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retreg3Q9CQV4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retreg3Q9CQV4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retreg3Q9CQV4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retreg3Q9CQV4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retreg3Q9CQV4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retreg3Q9CQV4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retreg3Q9CQV4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retreg3Q9CQV4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retreg3Q9CQV4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retreg3Q9CQV4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retreg3Q9CQV4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retreg3Q9CQV4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retreg3Q9CQV4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retreg3Q9CQV4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retreg3Q9CQV4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retreg3Q9CQV4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retreg3Q9CQV4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retreg3Q9CQV4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retreg3Q9CQV4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retreg3Q9CQV4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retreg3Q9CQV4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retreg3Q9CQV4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retreg3Q9CQV4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retreg3Q9CQV4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retreg3Q9CQV4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retreg3Q9CQV4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retreg3Q9CQV4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retreg3Q9CQV4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retreg3Q9CQV4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retreg3Q9CQV4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retreg3Q9CQV4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retreg3Q9CQV4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retreg3Q9CQV4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retreg3Q9CQV4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retreg3Q9CQV4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retreg3Q9CQV4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retreg3Q9CQV4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retreg3Q9CQV4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retreg3Q9CQV4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retreg3Q9CQV4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retreg3Q9CQV4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retreg3Q9CQV4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms