Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS6

Gkn2, Gastrokine-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkn2Q9CQS6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gkn2Q9CQS6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gkn2Q9CQS6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gkn2Q9CQS6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gkn2Q9CQS6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gkn2Q9CQS6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gkn2Q9CQS6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gkn2Q9CQS6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gkn2Q9CQS6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gkn2Q9CQS6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gkn2Q9CQS6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gkn2Q9CQS6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gkn2Q9CQS6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gkn2Q9CQS6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gkn2Q9CQS6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gkn2Q9CQS6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gkn2Q9CQS6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gkn2Q9CQS6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gkn2Q9CQS6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gkn2Q9CQS6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gkn2Q9CQS6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gkn2Q9CQS6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gkn2Q9CQS6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gkn2Q9CQS6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gkn2Q9CQS6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gkn2Q9CQS6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gkn2Q9CQS6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gkn2Q9CQS6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gkn2Q9CQS6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gkn2Q9CQS6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gkn2Q9CQS6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gkn2Q9CQS6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Gkn2Q9CQS6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gkn2Q9CQS6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gkn2Q9CQS6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gkn2Q9CQS6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gkn2Q9CQS6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gkn2Q9CQS6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gkn2Q9CQS6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gkn2Q9CQS6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gkn2Q9CQS6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gkn2Q9CQS6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gkn2Q9CQS6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gkn2Q9CQS6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gkn2Q9CQS6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gkn2Q9CQS6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gkn2Q9CQS6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gkn2Q9CQS6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gkn2Q9CQS6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gkn2Q9CQS6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gkn2Q9CQS6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gkn2Q9CQS6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gkn2Q9CQS6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gkn2Q9CQS6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gkn2Q9CQS6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gkn2Q9CQS6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gkn2Q9CQS6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gkn2Q9CQS6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gkn2Q9CQS6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gkn2Q9CQS6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gkn2Q9CQS6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gkn2Q9CQS6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gkn2Q9CQS6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gkn2Q9CQS6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gkn2Q9CQS6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gkn2Q9CQS6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gkn2Q9CQS6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gkn2Q9CQS6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gkn2Q9CQS6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gkn2Q9CQS6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gkn2Q9CQS6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gkn2Q9CQS6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gkn2Q9CQS6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gkn2Q9CQS6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gkn2Q9CQS6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gkn2Q9CQS6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gkn2Q9CQS6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gkn2Q9CQS6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gkn2Q9CQS6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gkn2Q9CQS6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gkn2Q9CQS6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gkn2Q9CQS6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gkn2Q9CQS6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gkn2Q9CQS6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gkn2Q9CQS6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gkn2Q9CQS6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gkn2Q9CQS6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Gkn2Q9CQS6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gkn2Q9CQS6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gkn2Q9CQS6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gkn2Q9CQS6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gkn2Q9CQS6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gkn2Q9CQS6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gkn2Q9CQS6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gkn2Q9CQS6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gkn2Q9CQS6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gkn2Q9CQS6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gkn2Q9CQS6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gkn2Q9CQS6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gkn2Q9CQS6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms