Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rwdd1Q9CQK7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rwdd1Q9CQK7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rwdd1Q9CQK7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rwdd1Q9CQK7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rwdd1Q9CQK7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rwdd1Q9CQK7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rwdd1Q9CQK7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rwdd1Q9CQK7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rwdd1Q9CQK7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rwdd1Q9CQK7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Rwdd1Q9CQK7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rwdd1Q9CQK7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Rwdd1Q9CQK7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Rwdd1Q9CQK7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Rwdd1Q9CQK7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rwdd1Q9CQK7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rwdd1Q9CQK7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rwdd1Q9CQK7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rwdd1Q9CQK7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Rwdd1Q9CQK7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rwdd1Q9CQK7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rwdd1Q9CQK7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rwdd1Q9CQK7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rwdd1Q9CQK7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rwdd1Q9CQK7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rwdd1Q9CQK7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rwdd1Q9CQK7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rwdd1Q9CQK7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rwdd1Q9CQK7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Rwdd1Q9CQK7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rwdd1Q9CQK7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rwdd1Q9CQK7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rwdd1Q9CQK7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rwdd1Q9CQK7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rwdd1Q9CQK7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rwdd1Q9CQK7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rwdd1Q9CQK7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rwdd1Q9CQK7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rwdd1Q9CQK7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rwdd1Q9CQK7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rwdd1Q9CQK7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rwdd1Q9CQK7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rwdd1Q9CQK7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rwdd1Q9CQK7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rwdd1Q9CQK7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rwdd1Q9CQK7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rwdd1Q9CQK7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rwdd1Q9CQK7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Rwdd1Q9CQK7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Rwdd1Q9CQK7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rwdd1Q9CQK7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rwdd1Q9CQK7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Rwdd1Q9CQK7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rwdd1Q9CQK7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Rwdd1Q9CQK7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rwdd1Q9CQK7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rwdd1Q9CQK7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rwdd1Q9CQK7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rwdd1Q9CQK7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rwdd1Q9CQK7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rwdd1Q9CQK7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rwdd1Q9CQK7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Rwdd1Q9CQK7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rwdd1Q9CQK7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rwdd1Q9CQK7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rwdd1Q9CQK7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rwdd1Q9CQK7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rwdd1Q9CQK7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rwdd1Q9CQK7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rwdd1Q9CQK7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Rwdd1Q9CQK7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rwdd1Q9CQK7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rwdd1Q9CQK7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rwdd1Q9CQK7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rwdd1Q9CQK7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Rwdd1Q9CQK7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rwdd1Q9CQK7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rwdd1Q9CQK7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Rwdd1Q9CQK7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rwdd1Q9CQK7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rwdd1Q9CQK7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rwdd1Q9CQK7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rwdd1Q9CQK7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rwdd1Q9CQK7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rwdd1Q9CQK7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rwdd1Q9CQK7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rwdd1Q9CQK7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rwdd1Q9CQK7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Rwdd1Q9CQK7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rwdd1Q9CQK7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rwdd1Q9CQK7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rwdd1Q9CQK7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rwdd1Q9CQK7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Rwdd1Q9CQK7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rwdd1Q9CQK7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rwdd1Q9CQK7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rwdd1Q9CQK7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rwdd1Q9CQK7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rwdd1Q9CQK7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms