Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI9

Med30, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 30, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med30Q9CQI9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med30Q9CQI9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Med30Q9CQI9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Med30Q9CQI9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Med30Q9CQI9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Med30Q9CQI9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Med30Q9CQI9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Med30Q9CQI9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Med30Q9CQI9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Med30Q9CQI9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Med30Q9CQI9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Med30Q9CQI9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Med30Q9CQI9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Med30Q9CQI9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Med30Q9CQI9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Med30Q9CQI9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Med30Q9CQI9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Med30Q9CQI9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Med30Q9CQI9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Med30Q9CQI9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Med30Q9CQI9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Med30Q9CQI9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Med30Q9CQI9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Med30Q9CQI9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Med30Q9CQI9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Med30Q9CQI9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Med30Q9CQI9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Med30Q9CQI9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Med30Q9CQI9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Med30Q9CQI9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Med30Q9CQI9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Med30Q9CQI9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Med30Q9CQI9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Med30Q9CQI9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Med30Q9CQI9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Med30Q9CQI9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Med30Q9CQI9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Med30Q9CQI9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Med30Q9CQI9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med30Q9CQI9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med30Q9CQI9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med30Q9CQI9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med30Q9CQI9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med30Q9CQI9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med30Q9CQI9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med30Q9CQI9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med30Q9CQI9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Med30Q9CQI9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Med30Q9CQI9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Med30Q9CQI9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Med30Q9CQI9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Med30Q9CQI9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Med30Q9CQI9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Med30Q9CQI9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Med30Q9CQI9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Med30Q9CQI9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Med30Q9CQI9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med30Q9CQI9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med30Q9CQI9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med30Q9CQI9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med30Q9CQI9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med30Q9CQI9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med30Q9CQI9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med30Q9CQI9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med30Q9CQI9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med30Q9CQI9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med30Q9CQI9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med30Q9CQI9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med30Q9CQI9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med30Q9CQI9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med30Q9CQI9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med30Q9CQI9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med30Q9CQI9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med30Q9CQI9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med30Q9CQI9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med30Q9CQI9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med30Q9CQI9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med30Q9CQI9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med30Q9CQI9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med30Q9CQI9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med30Q9CQI9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med30Q9CQI9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Med30Q9CQI9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med30Q9CQI9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med30Q9CQI9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Med30Q9CQI9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med30Q9CQI9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med30Q9CQI9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med30Q9CQI9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med30Q9CQI9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med30Q9CQI9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med30Q9CQI9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med30Q9CQI9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med30Q9CQI9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med30Q9CQI9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med30Q9CQI9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med30Q9CQI9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med30Q9CQI9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Med30Q9CQI9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Med30Q9CQI9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms