Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nipsnap3bQ9CQE1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nipsnap3bQ9CQE1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nipsnap3bQ9CQE1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nipsnap3bQ9CQE1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nipsnap3bQ9CQE1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nipsnap3bQ9CQE1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nipsnap3bQ9CQE1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nipsnap3bQ9CQE1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nipsnap3bQ9CQE1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nipsnap3bQ9CQE1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nipsnap3bQ9CQE1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms